Vaccine breakthrough hypoxemic COVID-19 pneumonia in patients with auto-Abs neutralizing type I IFNs
Notice bibliographique
Résumé
Life-threatening "breakthrough" cases of critical COVID-19 are attributed to poor or waning antibody (Ab) response to SARS-CoV-2 vaccines in individuals already at risk. Preexisting auto-Abs neutralizing type I IFNs underlie at least 15% of critical COVID-19 pneumonia cases in unvaccinated individuals; their contribution to hypoxemic breakthrough cases in vaccinated people is unknown. We studied a cohort of 48 individuals (aged 20 to 86 years) who received two doses of a messenger RNA (mRNA) vaccine and developed a breakthrough infection with hypoxemic COVID-19 pneumonia 2 weeks to 4 months later. Ab levels to the vaccine, neutralization of the virus, and auto-Abs to type I IFNs were measured in the plasma. Forty-two individuals had no known deficiency of B cell immunity and a normal Ab response to the vaccine. Among them, 10 (24%) had auto-Abs neutralizing type I IFNs (aged 43 to 86 years). Eight of these 10 patients had auto-Abs neutralizing both IFN-α2 and IFN-ω, whereas two neutralized IFN-ω only. No patient neutralized IFN-β. Seven neutralized type I IFNs at 10 ng/ml and three at 100 pg/ml only. Seven patients neutralized SARS-CoV-2 D614G and Delta efficiently, whereas one patient neutralized Delta slightly less efficiently. Two of the three patients neutralizing only type I IFNs at 100 pg/ml neutralized both D614G and Delta less efficiently. Despite two mRNA vaccine inoculations and the presence of circulating Abs capable of neutralizing SARS-CoV-2, auto-Abs neutralizing type I IFNs may underlie a notable proportion of hypoxemic COVID-19 pneumonia cases, highlighting the importance of this particularly vulnerable population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».