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Enregistrement W4282832723 · doi:10.7554/elife.72418

Analysis of combinatorial chemokine receptor expression dynamics using multi-receptor reporter mice

2022· article· en· W4282832723 sur OpenAlexaff
Laura Medina‐Ruiz, Robin Bartolini, Gillian Wilson, Douglas P. Dyer, Francesca Vidler, Catherine E. Hughes, Fabian Schuette, Samantha Love, Marieke Pingen, Alan J. Hayes, Jun Fu, A. Francis Stewart, Gerard J. Graham

Notice bibliographique

RevueeLife · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversity of GlasgowWellcome TrustWellcome
Mots-clésCCR1Chemokine receptorChemokineChemokine receptor CCR5BiologyCCL21CCR10C-C chemokine receptor type 6CCL13CXCL2Cell biologyCX3CL1CC chemokine receptorsReceptorCCL7Receptor expressionImmunologyInflammationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inflammatory chemokines and their receptors are central to the development of inflammatory/immune pathologies. The apparent complexity of this system, coupled with lack of appropriate in vivo models, has limited our understanding of how chemokines orchestrate inflammatory responses and has hampered attempts at targeting this system in inflammatory disease. Novel approaches are therefore needed to provide crucial biological, and therapeutic, insights into the chemokine-chemokine receptor family. Here, we report the generation of transgenic multi-chemokine receptor reporter mice in which spectrally distinct fluorescent reporters mark expression of CCRs 1, 2, 3, and 5, key receptors for myeloid cell recruitment in inflammation. Analysis of these animals has allowed us to define, for the first time, individual and combinatorial receptor expression patterns on myeloid cells in resting and inflamed conditions. Our results demonstrate that chemokine receptor expression is highly specific, and more selective than previously anticipated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,182
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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