Molecular analysis suggests oligoclonality and metastasis of endometriosis lesions across anatomically defined subtypes
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To investigate the heterogeneity of somatic cancer-driver mutations within patients and across endometriosis types. DESIGN: A single-center cohort, retrospective study. SETTING: Tertiary specialist-care center at a university hospital. PATIENT(S): Patients with surgically and histologically confirmed endometriosis of at least 2 anatomically distinct types (ovarian, deep infiltrating, and superficial). INTERVENTION(S): None. MAIN OUTCOME MEASURE(S): Specimens were analyzed for the presence or absence of somatic cancer-driver mutations using targeted panel sequencing with orthogonal validation using droplet digital polymerase chain reaction and mutation-surrogate immunohistochemistry. RESULT(S): It was found that 13 of 27 patients had informative somatic driver mutations in endometriosis lesions; of these 13 patients, 9 had identical mutations across distinct lesions. Endometriomas showed a higher mutational complexity, with functionally redundant driver mutations in the same gene and within the same lesions. CONCLUSION(S): Our data are consistent with clonality across endometriosis lesions, regardless of subtype. Further, the finding of redundancy in mutations within the same gene and lesions is consistent with endometriosis representing an oligoclonal disease with dissemination likely to consist of multiple epithelial clones traveling together. This suggests that the current anatomically defined classification of endometriosis does not fully recognize the etiology of the disease. A novel classification should consider genomic and other molecular features to promote personalized endometriosis diagnosis and care.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».