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Enregistrement W4282925834 · doi:10.1158/1538-7445.am2022-1506

Abstract 1506: <i>APOBEC3A a</i> causative agent in cancer-related chromosomal instability and STING driven metastasis

2022· article· en· W4282925834 sur OpenAlexaff
Sonja M. Woermann, Amy Zhang, Fredrik I. Thege, Chris Gates, Reuben S. Harris, Susan R. Ross, Faiyaz Notta, Anirban Maitra, Andrew D. Rhim

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchCancerChromosome instabilityCytidine deaminasePancreatic cancerDownregulation and upregulationBiologyMetastasisMedicineGeneticsGeneChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Chromosomal instability (CIN), a hallmark of cancer, has been associated with a highly metastatic phenotype in numerous cancers. Mechanisms by which these genomic events occur during the lifespan of a neoplasm have yet to be fully delineated. In our study we identified a novel function for APOBEC3A (A3A), a primate-specific cytidine deaminase upregulated in multiple cancers including Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), in the initiation of CIN.We demonstrate that A3A is not routinely detected in non-diseased pancreata; however, expression was detected in the epithelial and stromal compartments from patients with chronic pancreatitis and in precursor lesions of PDAC and is further significantly increased in invasive neoplasia. Strikingly, we found that A3A expression but not A3A-induced mutagenesis, was associated with a significantly reduced overall survival in PDAC. By employing a variety of genetic tools, we identified a novel function for A3A in initiating CIN, underscoring its potential role in driving the observed early metastatic propensity in PDAC. Using a series of in vivo and in vitro models, we demonstrate that A3A-induced CIN leads to aggressive cancer, featuring enhanced, STING-dependent, distant organ seeding and metastatic growth. As a consequence of aberrant A3A function and CIN-mediated upregulation of STING, NfkB and Stat3 pathways were activated. More importantly, all these effects were independent of the deaminase domain, underscoring a novel role of A3A beyond its established canonical function. Remarkably, in a novel autochthonous murine model of PDA expressing human A3A, we identified numerous copy number changes, homologous to those altered in A3A overexpressing patient tumors, including deletions in DNA repair pathway genes. While we showed that A3A-expressing PDAC cells do not fully phenocopy a BRCA mutation-like phenotype, A3A-expressing PDAC cells are exceptionally sensitive to PARP inhibition and DNA cross linking agents, recapitulating a state of “chemical BRCAness”. The combined effect of deletions in these genes has yet to be ascertained, and we hypothesize that these losses further add to ongoing DNA damage overall in PDAC. In summary, our study shows, that A3A drives metastasis and specific deletions through a deaminase-independent initiation of CIN, with potential implications for targeted treatment strategies in pancreatic cancer. Citation Format: Sonja Maria Woermann, Amy Zhang, Fredrik I. Thege, Chris Gates, Reuben S. Harris, Susan R. Ross, Faiyaz Notta, Anirban Maitra, Andrew D. Rhim. APOBEC3A a causative agent in cancer-related chromosomal instability and STING driven metastasis [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2022; 2022 Apr 8-13. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(12_Suppl):Abstract nr 1506.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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