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Enregistrement W4282932160 · doi:10.1158/1538-7445.am2022-3047

Abstract 3047: Investigating the interaction between the microbiome and mutant p53 in Li-Fraumeni Syndrome

2022· article· en· W4282932160 sur OpenAlexaff
Noel Ong, Camilla Giovino, Nicholas W. Fischer, Pamela Psarianos, David Malkin

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Research and Treatments
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLi–Fraumeni syndromeContext (archaeology)MicrobiomeCancerGermline mutationPopulationMedicineCancer researchGermlineLung cancerImmunologyOncologyBiologyMutationInternal medicineBioinformaticsGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Li-Fraumeni Syndrome (LFS) is a hereditary cancer predisposition syndrome in which affected individuals are prone to developing a wide spectrum of malignancies. LFS is caused by germline mutations in the TP53 tumour suppressor gene. LFS patients develop cancer significantly earlier than the general population and may experience multiple malignancies in their lifetime. Studies have indicated that environmental influences like radiation exposure and tobacco smoke may further increase cancer risk in LFS patients. Currently, there is no cure for LFS, and screening for early tumour detection is the standard of care for LFS patients. Recently, microbes have been found to be involved in cancer development, progression, and treatment responsiveness. Moreover, microbes have anti-tumourigenic properties that can be harnessed for therapeutic intervention. The interaction between microbes and cancer can be through contact-dependent, contact-independent, and/or immunological interactions. Profiling the microbiome in the context of cancer may provide prognostic and/or diagnostic options for patients. However, interactions between the microbiome and mutant p53 in LFS has not been studied to date. We induced dysbiosis using a combination of antibiotics in LFS mice harbouring the heterozygous Trp53 R172H mutation. Following 7 days of treatment, we challenged mice with subcutaneous injections of the MC38 colon adenocarcinoma cell line. We observed an increase in tumour volume in LFS mice treated with antibiotics; this change was not observed in p53 wildtype mice. These findings highlight potentially unique interactions between mutant p53 and the microbiome which influence tumour growth in the context of LFS. We also found that LFS mice treated with metformin have smaller tumours compared to untreated mice. A particular genus of bacteria, Faecalibaculum sp., was found to be upregulated in a cohort of metformin treated mice, and the abundance of this bacterium is inversely proportional to tumour volume. Zagato et al. have shown that Faecalibaculum rodentium has anti-tumourigenic properties through the production of short-chain fatty acid (SCFA). Altogether, these observations suggest that microbes may influence tumour growth in LFS mice. The study of interactions between the microbiome and mutant p53 and the influence of these interactions on cancer development in LFS may, with further study, provide avenues of prognostic and/or diagnostic interest. Differences in the microbiome in cancer-affected and cancer-free LFS patients may also introduce the possibility to exploit the microbiome for treatment and/or preventative purposes in these patients. Citation Format: Noel Wei Ong, Camilla Maria Giovino, Nicholas William Fischer, Pamela Psarianos, David Malkin. Investigating the interaction between the microbiome and mutant p53 in Li-Fraumeni Syndrome [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2022; 2022 Apr 8-13. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(12_Suppl):Abstract nr 3047.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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