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Enregistrement W4282938041 · doi:10.1101/2022.06.13.22276353

Heavy-tailed sexual contact networks and the epidemiology of monkeypox outbreak in non-endemic regions, May 2022

2022· preprint· en· W4282938041 sur OpenAlexfundno aff
Akira Endo, Hiroaki Murayama, Sam Abbott, Ruwan Ratnayake, Carl A. B. Pearson, W. John Edmunds, Elizabeth Fearon, Sebastian Funk

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceCanadian Institutes of Health ResearchEuropean CommissionUK Research and InnovationMedical Research CouncilEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsInnovative Medicines InitiativeWellcome Trust
Mots-clésMonkeypoxOutbreakMen who have sex with menTransmission (telecommunications)DemographyEpidemiologySexual contactBasic reproduction numberGeographyPublic healthPopulationVirologyBiologyMedicineHuman immunodeficiency virus (HIV)Sociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A global outbreak of monkeypox across non-endemic regions including Europe and North America was confirmed in May 2022. The current outbreak has shown distinct epidemiological features compared with past outbreaks in non-endemic settings, most notably its observed rapid growth and predominant spread among men who have sex with men (MSM). We use a branching process transmission model fitted to empirical sexual partnership data in the UK to show that the heavy-tailed nature of the sexual partnership degree distribution, where a small fraction of individuals have disproportionately large numbers of partners, can explain the sustained growth of monkeypox cases among the MSM population despite the absence of such patterns of spread in past outbreaks. We also suggest that the basic reproduction number ( R 0 ) for monkeypox over the MSM sexual contact network may be substantially greater than 1 for a plausible range of assumptions, which poses a challenge to outbreak containment efforts. Ensuring ongoing support and tailored public health messaging to facilitate prevention and early detection among MSM with a large number of sexual partners is warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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