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Enregistrement W4283018900 · doi:10.1038/s42003-022-03529-z

Genome-wide meta-analysis of iron status biomarkers and the effect of iron on all-cause mortality in HUNT

2022· review· en· W4283018900 sur OpenAlexaff
Marta R. Moksnes, Sarah E. Graham, Kuan-Han H. Wu, Ailin Falkmo Hansen, Sarah A. Gagliano Taliun, Wei Zhou, Ketil Thorstensen, Lars G. Fritsche, Dipender Gill, Amy M. Mason, Francesco Cucca, David Schlessinger, Gonçalo R. Abecasis, Stephen Burgess, Bjørn Olav Åsvold, Jonas B. Nielsen, Kristian Hveem, Cristen J. Willer, Ben Brumpton

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilFakultet for medisin og helsevitenskap, Norges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical School, University of MichiganNorwegian Institute of Public HealthNational Institutes of HealthDepartment of Health and Social CareNational Institute for Health and Care ResearchEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsBritish Heart FoundationWellcome TrustNorges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetHelse Midt-NorgeRoyal SocietyNorges ForskningsrådFaculty of Medicine and Health, University of SydneyUniversity of Michigan
Mots-clésTransferrin saturationMendelian randomizationTransferrinSerum ironIron deficiencyBiologyFerritinPopulationGeneticsGenome-wide association studyBiomarkerTransferrin receptorPhysiologyGenotypeBioinformaticsMedicineGeneInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismAnemiaGenetic variantsEndocrinologyEnvironmental healthBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Iron is essential for many biological processes, but iron levels must be tightly regulated to avoid harmful effects of both iron deficiency and overload. Here, we perform genome-wide association studies on four iron-related biomarkers (serum iron, serum ferritin, transferrin saturation, total iron-binding capacity) in the Trøndelag Health Study (HUNT), the Michigan Genomics Initiative (MGI), and the SardiNIA study, followed by their meta-analysis with publicly available summary statistics, analyzing up to 257,953 individuals. We identify 123 genetic loci associated with iron traits. Among 19 novel protein-altering variants, we observe a rare missense variant (rs367731784) in HUNT, which suggests a role for DNAJC13 in transferrin recycling. We further validate recently published results using genetic risk scores for each biomarker in HUNT (6% variance in serum iron explained) and present linear and non-linear Mendelian randomization analyses of the traits on all-cause mortality. We find evidence of a harmful effect of increased serum iron and transferrin saturation in linear analyses that estimate population-averaged effects. However, there was weak evidence of a protective effect of increasing serum iron at the very low end of its distribution. Our findings contribute to our understanding of the genes affecting iron status and its consequences on human health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,460
Score d'incertitude au seuil0,679

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,173
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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