MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4283033359 · doi:10.15252/embr.202154532

Metabolic routing maintains the unique fatty acid composition of phosphoinositides

2022· article· en· W4283033359 sur OpenAlexfundno aff
Yeun Ju Kim, Nivedita Sengupta, Mira Sohn, Amrita Mandal, Joshua G. Pemberton, Uimook Choi, Tamás Balla

Notice bibliographique

RevueEMBO Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesInstitut Périmètre de physique théoriqueUniversité de Strasbourg
Mots-clésPhosphatidic acidDiacylglycerol kinasePhosphatidylinositolBiochemistryArachidonic acidFatty acidChemistryPhosphatidatePhospholipaseLipid metabolismBiologySignal transductionPhospholipidEnzymeProtein kinase C

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Phosphoinositide lipids (PPIn) are enriched in stearic‐ and arachidonic acids (38:4) but how this enrichment is established and maintained during phospholipase C (PLC) activation is unknown. Here we show that the metabolic fate of newly synthesized phosphatidic acid (PA), the lipid precursor of phosphatidylinositol (PI), is influenced by the fatty acyl‐CoA used with preferential routing of the arachidonoyl‐enriched species toward PI synthesis. Furthermore, during agonist stimulation the unsaturated forms of PI(4,5P) 2 are replenished significantly faster than the more saturated ones, suggesting a favored recycling of the unsaturated forms of the PLC‐generated hydrolytic products. Cytidine diphosphate diacylglycerol synthase 2 (CDS2) but not CDS1 was found to contribute to increased PI resynthesis during PLC activation. Lastly, while the lipid transfer protein, Nir2 is found to contribute to rapid PPIn resynthesis during PLC activation, the faster re‐synthesis of the 38:4 species does not depend on Nir2. Therefore, the fatty acid side‐chain composition of the lipid precursors used for PI synthesis is an important determinant of their metabolic fates, which also contributes to the maintenance of the unique fatty acid profile of PPIn lipids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil0,359

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEMBO ReportsMême sujetLipid metabolism and biosynthesisTravaux en français237 207