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Enregistrement W4283259569 · doi:10.1038/s41379-022-01104-9

Systematically higher Ki67 scores on core biopsy samples compared to corresponding resection specimen in breast cancer: a multi-operator and multi-institutional study

2022· article· en· W4283259569 sur OpenAlexaff
Balázs Ács, Samuel Leung, Kelley M. Kidwell, Indu Arun, Renaldas Augulis, Sunil Badve, Yalai Bai, Anita Bane, John M.S. Bartlett, Jane Bayani, Gilbert Bigras, Annika Blank, Henk J. Buikema, Martin C. Chang, R Dietz, Andrew Dodson, Susan Fineberg, Cornelia M. Focke, Dongxia Gao, Allen M. Gown, Carolina Gutiérrez, Johan Hartman, Zuzana Kos, Anne‐Vibeke Lænkholm, Arvydas Laurinavičius, Richard M. Levenson, R. Mahboubi-Ardakani, Mauro G. Mastropasqua, Sharon Nofech‐Mozes, C. Kent Osborne, Frédérique Penault‐Llorca, Tammy Piper, Mary Anne Quintayo, Tilman T. Rau, Stefan Reinhard, Stephanie Robertson, Roberto Salgado, Tomoharu Sugie, Bert van der Vegt, Giuseppe Viale, Lila Zabaglo, Daniel F. Hayes, Mitch Dowsett, Torsten O. Nielsen, David L. Rimm, Lisa M. McShane, Signe Borgquist, Angela Chan, Carsten Denkert, Anna Ehinger, Matthew J. Ellis, Margaret Flowers, Chad Galderisi, Abhi Gholap, Douglas J. Hartman, Judith Hugh, Anagha P. Jadhav, Elizabeth Kornaga, Hans Kreipe, Mauro Mastropasqua, Takuya Moriya, Hongchao Pan, Liron Pantanowitz, Ernesta Paola Neri, Mei‐Yin C. Polley, Jason Ruan, Takashi Sakatani, Lois E. Shepherd, Ian Smith, Joseph A. Sparano, Melanie Spears, Jane Starczynski, Austin Todd, Shakeel Virk, Yihong Wang, Hua Yang, Zhiwei Zhang, Inti Zlobec

Notice bibliographique

RevueModern Pathology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreUniversity of AlbertaOntario Institute for Cancer ResearchMcMaster UniversityJuravinski HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational Sciences
Mots-clésBiopsyMedicineBreast cancerCore biopsyImmunohistochemistryPathologyRadiologyCancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ki67 has potential clinical importance in breast cancer but has yet to see broad acceptance due to inter-laboratory variability. Here we tested an open source and calibrated automated digital image analysis (DIA) platform to: (i) investigate the comparability of Ki67 measurement across corresponding core biopsy and resection specimen cases, and (ii) assess section to section differences in Ki67 scoring. Two sets of 60 previously stained slides containing 30 core-cut biopsy and 30 corresponding resection specimens from 30 estrogen receptor-positive breast cancer patients were sent to 17 participating labs for automated assessment of average Ki67 expression. The blocks were centrally cut and immunohistochemically (IHC) stained for Ki67 (MIB-1 antibody). The QuPath platform was used to evaluate tumoral Ki67 expression. Calibration of the DIA method was performed as in published studies. A guideline for building an automated Ki67 scoring algorithm was sent to participating labs. Very high correlation and no systematic error (p = 0.08) was found between consecutive Ki67 IHC sections. Ki67 scores were higher for core biopsy slides compared to paired whole sections from resections (p ≤ 0.001; median difference: 5.31%). The systematic discrepancy between core biopsy and corresponding whole sections was likely due to pre-analytical factors (tissue handling, fixation). Therefore, Ki67 IHC should be tested on core biopsy samples to best reflect the biological status of the tumor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,567
Score d'incertitude au seuil0,697

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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