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Enregistrement W4283656267 · doi:10.1158/2159-8290.cd-21-0576

Drug-Induced Epigenomic Plasticity Reprograms Circadian Rhythm Regulation to Drive Prostate Cancer toward Androgen Independence

2022· article· en· W4283656267 sur OpenAlexaff
Simon Linder, Marlous Hoogstraat, Suzan Stelloo, Nils Eickhoff, Karianne Schuurman, Hilda A. de Barros, Maartje Alkemade, Elise M. Bekers, Tesa Severson, Joyce Sanders, Chia-Chi Flora Huang, Tunç Morova, Umut Berkay Altıntaş, Liesbeth Hoekman, Yongsoo Kim, Sylvan C. Baca, Martin Sjöström, Anniek Zaalberg, Dorine C. Hintzen, Jeroen de Jong, Roelof J.C. Kluin, Iris de Rink, Claudia Giambartolomei, Ji-Heui Seo, Bogdan Paşaniuc, Maarten Altelaar, René H. Medema, Felix Y. Feng, Amina Zoubeidi, Matthew L. Freedman, Lodewyk F.A. Wessels, Lisa M. Butler, Nathan A. Lack, Henk G. van der Poel, Andries M. Bergman, Wilbert Zwart

Notice bibliographique

RevueCancer Discovery · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesAstellas PharmaNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNational Cancer InstituteZonMwMovember Foundation
Mots-clésEpigenomicsProstate cancerCircadian rhythmAndrogenIndependence (probability theory)BiologyMelatoninDrugCancerNeuroscienceEndocrinologyPharmacologyHormoneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In prostate cancer, androgen receptor (AR)-targeting agents are very effective in various disease stages. However, therapy resistance inevitably occurs, and little is known about how tumor cells adapt to bypass AR suppression. Here, we performed integrative multiomics analyses on tissues isolated before and after 3 months of AR-targeting enzalutamide monotherapy from patients with high-risk prostate cancer enrolled in a neoadjuvant clinical trial. Transcriptomic analyses demonstrated that AR inhibition drove tumors toward a neuroendocrine-like disease state. Additionally, epigenomic profiling revealed massive enzalutamide-induced reprogramming of pioneer factor FOXA1 from inactive chromatin sites toward active cis-regulatory elements that dictate prosurvival signals. Notably, treatment-induced FOXA1 sites were enriched for the circadian clock component ARNTL. Posttreatment ARNTL levels were associated with patients' clinical outcomes, and ARNTL knockout strongly decreased prostate cancer cell growth. Our data highlight a remarkable cistromic plasticity of FOXA1 following AR-targeted therapy and revealed an acquired dependency on the circadian regulator ARNTL, a novel candidate therapeutic target. SIGNIFICANCE: Understanding how prostate cancers adapt to AR-targeted interventions is critical for identifying novel drug targets to improve the clinical management of treatment-resistant disease. Our study revealed an enzalutamide-induced epigenomic plasticity toward prosurvival signaling and uncovered the circadian regulator ARNTL as an acquired vulnerability after AR inhibition, presenting a novel lead for therapeutic development. See related commentary by Zhang et al., p. 2017. This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 2007.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,223
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations86
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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