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Enregistrement W4283692145 · doi:10.1016/j.celrep.2022.110989

Early IFNβ secretion determines variable downstream IL-12p70 responses upon TLR4 activation

2022· article· en· W4283692145 sur OpenAlexafffund
Céline Posseme, Alba Llibre, Bruno Charbit, Vincent Bondet, Vincent Rouilly, Violaine Saint‐André, Jérémy Boussier, Jacob Bergstedt, Nikaïa Smith, Liam Townsend, Jamie Sugrue, Clíona Ní Cheallaigh, Niall Conlon, Maxime Rotival, Michael S. Kobor, Estelle Mottez, Stanislas Pol, Étienne Patin, Matthew L. Albert, Lluís Quintana‐Murci, Darragh Duffy, Laurent Abel, Andrés Alcover, Hugues Aschard, Philippe Bousso, Nollaig M. Bourke, Petter Brodin, Pierre Bruhns, Nadine Cerf–Bensussan, Ana Cumano, Caroline Demangel, Christophe d’Enfert, Ludovic Deriano, Marie‐Agnès Dillies, James P. Di Santo, Françoise Dromer, Gérard Eberl, Jost Enninga, Jacques Fellay, Milena Hasan, Magnus Fontes, Gunilla Karlsson Hedestam, Serge Herçberg, Molly A. Ingersoll, Rose Anne Kenny, Olivier Lantz, Mickaël Ménager, Frédérique Michel, Hugo Mouquet, Cliona O’Farrelly, Sandra Pellegrini, Antonio Rausell, Frédéric Rieux‐Laucat, Lars Rogge, Anavaj Sakuntabhai, Olivier Schwartz, Benno Schwikowski, Spencer Shorte, Frédéric Tangy, Antoine Toubert, Mathilde Touvier, Marie‐Noëlle Ungeheuer, Christophe Zimmer

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMount Allison UniversityInstitut PasteurAgence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites ViralesAgence Nationale de la RechercheScience Foundation IrelandHealth Research BoardHealth Service ExecutiveWellcome TrustInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCanadian Institute for Theoretical Astrophysics
Mots-clésImmunologyImmune systemCytokine stormLipopolysaccharideTLR4InterferonCytokineSecretionBiologyMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)DiseaseInfectious disease (medical specialty)Internal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interleukin-12 (IL-12) family comprises the only heterodimeric cytokines mediating diverse functional effects. We previously reported a striking bimodal IL-12p70 response to lipopolysaccharide (LPS) stimulation in healthy donors. Herein, we demonstrate that interferon β (IFNβ) is a major upstream determinant of IL-12p70 production, which is also associated with numbers and activation of circulating monocytes. Integrative modeling of proteomic, genetic, epigenomic, and cellular data confirms IFNβ as key for LPS-induced IL-12p70 and allowed us to compare the relative effects of each of these parameters on variable cytokine responses. Clinical relevance of our findings is supported by reduced IFNβ-IL-12p70 responses in patients hospitalized with acute severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection or chronically infected with hepatitis C (HCV). Importantly, these responses are resolved after viral clearance. Our systems immunology approach defines a better understanding of IL-12p70 and IFNβ in healthy and infected persons, providing insights into how common genetic and epigenetic variation may impact immune responses to bacterial infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,572
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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