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Enregistrement W4284994282 · doi:10.1101/2022.07.05.498916

Validated Preclinical Murine Model for Therapeutic Testing against Multidrug Resistant <i>Pseudomonas aeruginosa</i>

2022· preprint· en· W4284994282 sur OpenAlexfundno aff
Jonathan M. Warawa, Xiaoxian Duan, Charles D. Anderson, Julie Sotsky, Daniel Cramer, Tia L. Pfeffer, Haixun Guo, Robert S. Adcock, Alexander J. Lepak, David R. Andes, Stacey Slone, Arnold J. Stromberg, Jon D. Gabbard, William E. Severson, Matthew B. Lawrenz

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHamilton Health Sciences Foundation
Mots-clésPseudomonas aeruginosaAcinetobacter baumanniiEnterococcus faeciumAntimicrobialAntibioticsMicrobiologyAntibiotic resistanceAztreonamMultiple drug resistanceBiologyMedicineBacteriaImipenem

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The rise in infections caused by antibiotic resistant bacteria is outpacing the development of new antibiotics. The ESKAPE pathogens ( Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa , and Enterobacter species) are a group of clinically important bacteria that have developed resistance to multiple antibiotics and are commonly referred to as multidrug resistant (MDR). The medical and research communities have recognized that without new antimicrobials, infections by MDR bacteria will soon become a leading cause of morbidity and mortality. Therefore, there is an ever growing need to expedite the development of novel antimicrobials to combat these infections. Toward this end, we set out to refine an existing murine model of pulmonary Pseudomonas aeruginosa infection to generate a robust preclinical tool that can be used to rapidly and accurately predict novel antimicrobial efficacy. This refinement was achieved by characterizing the virulence of a panel of genetically diverse MDR P. aeruginosa strains in this model, both by LD 50 analysis and natural history studies. Further, we defined two antibiotic regimens (aztreonam and amikacin) that can be used a comparators during the future evaluation of novel antimicrobials, and validated that the model can effectively differentiate between successful and unsuccessful treatment as predicted by in vitro inhibitory data. This validated model represents an important tool in our arsenal to develop new therapies to combat MDR P. aeruginosa , with the ability to provide rapid preclinical evaluation of novel antimicrobials that can also serve to support data from clinical studies during the investigational drug development process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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