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Enregistrement W4285029755 · doi:10.1139/cjps-2022-0046

Correlations between soybean seed quality traits using a genome-wide association study panel grown in Canadian and Ukrainian mega-environments

2022· article· en· W4285029755 sur OpenAlexaffvenueabout
Huilin Hong, Mohsen Yoosefzadeh-Najafabadi, Istvan Rajcan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBiplotOleic acidTraitStearic acidQuantitative trait locusPalmitic acidAgronomyGenetic correlationLinolenic acidGenotypeBiotechnologyFatty acidGenetic variationBotanyLinoleic acidGeneGeneticsChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Improvement of soybean [ Glycine max (L.) Merr.] seed quality traits in addition to agronomic traits requires a detailed understanding of correlations between these traits. The objective of this study was to determine the correlations between seed compositions in soybeans grown in Canadian and Ukrainian mega-environments (MEs). The correlations between seed quality traits and agronomic traits were also studied. A genome-wide association study panel consisting of 184 soybean accessions was used for the study. The panel was grown in three Ontario field locations and two Ukrainian locations for 2 years, from 2018 to 2019. A total of 18 traits were measured and analyzed. The Pearson's correlation coefficients ( r) were calculated, and the genotype-by-trait biplots were generated to analyze the linear correlations between the traits. The well-documented negative correlations between protein and oil, as well as oil and the amino acids Lys, Cys, Met, and Thr, were confirmed. In addition, a positive correlation was observed between stearic acid and palmitic acid, while linolenic acid and oleic acid concentrations were negatively correlated. Sucrose was positively correlated with linolenic acid and raffinose and negatively with protein and the four amino acids. Most of the agronomic traits had positive correlations with each other, while there was no strong linear association detected between agronomic traits and the seed quality traits in either ME. The results of this study suggest that improvement of yield and other agronomic traits through breeding may be possible in both Canada and Ukraine without affecting the important seed quality traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,510
Score d'incertitude au seuil0,865

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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