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Enregistrement W4285034525 · doi:10.1021/acsnano.2c03055

Glioblastoma Associated Natural Killer Cell EVs Generating Tumour-Specific Signatures: Noninvasive GBM Liquid Biopsy with Self-Functionalized Quantum Probes

2022· article· en· W4285034525 sur OpenAlexafffund
Deeptha Ishwar, Rupa Haldavnekar, Sunit Das, Bo Tan, Krishnan Venkatakrishnan

Notice bibliographique

RevueACS Nano · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto Metropolitan UniversitySt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCirculating tumor cellLiquid biopsyCancer researchImmune systemBrain tumorExtracellular vesiclesCellBiomarkerMedicineBiologyImmunologyPathologyCancerCell biologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diagnosis of glioblastoma (GBM) poses a recurring struggle due to many factors, including the presence of the blood-brain barrier (BBB) in addition to the significant tumor heterogeneity. Natural killer (NK) cells of the innate immune system are the primary immune surveillance mechanism for GBM and identify GBM tumors without any previous sensitization. The metabolic reprogramming of NK cells during GBM association is expected to be reflected in its extracellular vesicles. Therefore, tracking the activity of NK cell vesicles in circulation (circulating immune vesicles, CIVs) has great potential for accurate GBM diagnosis. However, identification GBM associated CIVs in circulation is immensely challenging as there is no availability of clinically validated GBM-specific circulating biomarkers. Here, we present GBM associated CIV profiling for noninvasive GBM diagnosis. We investigated the feasibility of using the signals derived from GBM associated CIVs as a de novo methodology for GBM diagnosis. An ultrasensitive sensor and a marker-free approach were essential for the detection of rare signals of GBM associated CIVs. For this purpose, we designed GBM ImmunoProfiler platform using scalable ultrafast laser multiphoton ionization mechanism and adopted surface enhanced Raman spectroscopy (SERS) ensuring simultaneous detection of multiple CIV signals to identify GBM. We experimentally demonstrated that GBM associated CIVs carry unique, tumor-specific signals. The features of GBM associated CIVs were explored through machine learning identifying its similarity with GBM patient blood (without cell isolation) using a very small amount of peripheral blood (5 μL) with 96.82% sensitivity and 100% specificity. In addition, we demonstrated that a tumor associated CIV profile can classify between multiple brain cancer types (astrocytoma, oligodendroglioma, and glioblastoma). We also experimentally demonstrated significant variation in the immune checkpoint protein expression (PDL-1 and CTLA-4) between GBM associated CIVs and uninteracted CIVs. Preclinical analysis with serum specimens of GBM patients showed the possibility of using our technology for minimally invasive GBM diagnosis. With clinical validation, our technology has potential to improve GBM diagnostics with a useful, minimally invasive GBM liquid biopsy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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