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Enregistrement W4285160976 · doi:10.5376/jtsr.2022.12.0001

Gene Expression Profiling Analysis of Resistant and Susceptible Tea Cultivars in Response to Tea Blister Blight (<i>Exobosidium vexans</i> Massee)

2022· article· en· W4285160976 sur OpenAlex
Yaqin Long, Longxun Ran, Lifei Xia, Hao Qu, Yiping Tian, Linbo Chen, Mingzhi Liang

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Tea Science Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneGene expressionGene expression profilingTranscriptomeSecondary metabolismPlant disease resistanceGeneticsBiosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The resistant and susceptible tea cultivars were selected for revealing the defense response mechanism induced by tea blister blight. The DEGs before and after infection by tea blister blight were analyzed based on RNA sequencing and digital expression spectrum. The results showed a total of 974 DEGs were identified, of which 122 DEGs were co-expressed genes in both resistant and susceptible cultivars, 364 DEGs were specific genes only in blister disease-resistant cultivar, and 488 DEGs were specific genes only in blight disease-susceptible cultivar. The infection of tea blister blight mainly affected the expression levels of key genes involved in metabolic pathways, protein processing in endoplasmic reticulum, biosynthesis of secondary metabolites, plant-pathogen interaction, plant hormone signal transduction, starch and sucrose metabolism, phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis and so on. These DEGs included disease resistance protein gene, hydrolase gene, cell wall reinforcement genes, transcription factor genes, plant hormones and their signal transduction genes, secondary metabolism and oxidase genes, transporter gene and so on. The differential expressions of 6 genes were verified by Real-time quantitative PCR, which showed a general consistency consistent with the results of transcriptome sequencing. This study preliminarily clarified the influence of tea blister blight infection on gene transcription levels in tea plants with this study, which laid a theoretical foundation for researching the molecular mechanism of disease resistance in tea plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,556
Score d'incertitude au seuil0,617

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,008
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle