Gene Expression Profiling Analysis of Resistant and Susceptible Tea Cultivars in Response to Tea Blister Blight (<i>Exobosidium vexans</i> Massee)
Notice bibliographique
Résumé
The resistant and susceptible tea cultivars were selected for revealing the defense response mechanism induced by tea blister blight. The DEGs before and after infection by tea blister blight were analyzed based on RNA sequencing and digital expression spectrum. The results showed a total of 974 DEGs were identified, of which 122 DEGs were co-expressed genes in both resistant and susceptible cultivars, 364 DEGs were specific genes only in blister disease-resistant cultivar, and 488 DEGs were specific genes only in blight disease-susceptible cultivar. The infection of tea blister blight mainly affected the expression levels of key genes involved in metabolic pathways, protein processing in endoplasmic reticulum, biosynthesis of secondary metabolites, plant-pathogen interaction, plant hormone signal transduction, starch and sucrose metabolism, phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis and so on. These DEGs included disease resistance protein gene, hydrolase gene, cell wall reinforcement genes, transcription factor genes, plant hormones and their signal transduction genes, secondary metabolism and oxidase genes, transporter gene and so on. The differential expressions of 6 genes were verified by Real-time quantitative PCR, which showed a general consistency consistent with the results of transcriptome sequencing. This study preliminarily clarified the influence of tea blister blight infection on gene transcription levels in tea plants with this study, which laid a theoretical foundation for researching the molecular mechanism of disease resistance in tea plants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».