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Enregistrement W4285225789 · doi:10.5376/mpb.2022.13.0013

Cloning and Expression Analysis of <i>NAC2</i> Gene of Potato (<i>Solanum tuberosum L</i>)

2022· article· en· W4285225789 sur OpenAlexvenueno aff
Lulu Meng, Guandi He, Weijun Tian, Dandan Li, Yun Huang, Tengbing He

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGeneGene expressionBiologyMolecular biologyComplementary DNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NAC is one of the unique transcription factor families in plants, which plays an important regulatory role in response to abiotic stress. In this study, a NAC transcription factor gene StNAC2 was cloned in potato ‘Yunshu 505’ by RT-PCR. Sequence analysis showed that the ORF of StNAC2 gene was 876 bp, encoding 291 amino acids, including a conserved Nam domain with a molecular weight of 33.585 12 kD, a theoretical isoelectric point of 7.04, an instability coefficient of 50.33 and an average hydrophilic number of -0.660. Protein prediction results showed that StNAC2 protein is an unstable hydrophilic protein with no signal peptide and transmembrane domain, which can be expressed in both cytoplasm and mitochondria. Homology comparison and phylogenetic tree analysis showed that StNAC2 gene is closely related to Capsicum annuum and Nicotiana tab acum. Spatio-temporal expression results showed that the expression of StNAC2 gene was different in tissue, the expression of StNAC2 gene was higher in leaves than in stems. The expression of StNAC2 gene was induced under cadmium stress, and reached the maximum value at 50 mg/kg, but decreased significantly after being treated with 100 mg/kg cadmium, indicating that the expression of StNAC2 gene was inhibited under high concentration stress and StNAC2 gene could involve in cadmium stress. The results lay the foundation for dissecting the molecular mechanism of StNAC2 gene involved in Cd stress response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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