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Enregistrement W4285395213 · doi:10.1101/2022.07.12.499729

The CoQ biosynthetic di-iron carboxylate hydroxylase COQ7 is inhibited by in vivo metalation with manganese but remains function by metalation with cobalt

2022· preprint· en· W4285395213 sur OpenAlexafffund
Ying Wang, Siegfried Hekimi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCoenzyme Q10 studies and effects
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésManganeseCobaltChemistryMetalationEnzymeActive siteBiochemistryStereochemistryInorganic chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT COQ7 is a mitochondrial hydroxylase that catalyzes the penultimate step of the biosynthesis of coenzyme Q (CoQ; ubiquinone). CoQ is an obligate component of the mitochondrial electron transport chain and an antioxidant. CoQ deficiencies due to mutations in CoQ biosynthetic enzymes are severe genetic disorders often manifesting as mitochondrial disease syndrome. COQ7 is part of the relatively rare class of di-iron carboxylate enzymes, which carry out a wide range of reactions. In a previous study we described how COQ7 activity is inhibited in mammalian cells after treatment with iron chelating agents. Here, we report that manganese exposure of mouse cells leads to decreased COQ7 activity and resulting CoQ deficiency, which might participate in manganese toxicity. We find that the presence of cobalt can interfere with the inhibition of COQ7 by manganese. We present evidence that both manganese inhibition and cobalt interference are the result of metal exchange at the di-iron active site of COQ7. We present findings that suggest that 1) cobalt has greater affinity for the active site of COQ7 than both iron and manganese and, 2) that iron replacement by cobalt at the active site preserves catalytic activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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