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Enregistrement W4285498948 · doi:10.1016/j.crbiot.2022.07.001

Unraveling the mystery of subsurface microorganisms in bioremediation

2022· article· en· W4285498948 sur OpenAlexafffund
Gurpreet Kaur, Guneet Kaur, M. Król, Satinder Kaur Brar

Notice bibliographique

RevueCurrent Research in Biotechnology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaYork University
Mots-clésBioremediationMetagenomicsBiogeochemical cycleMicrobial population biologyBiochemical engineeringMicroorganismSubsurface flowBiodegradationEnvironmental scienceBiologyEcologyGroundwaterBacteriaEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microorganisms are the key players in biogeochemical processes in the shallow subsurface for bioremediation. Estimation of genetic diversity, microbial activity, and their metabolic functions are the most applicable methods to explore the biodegradation processes in the subsurface. Several techniques such as community-level physiological profiling, sequencing, metagenomics, enzyme assay, and culture-based methods are used to investigate the metabolic potential, functional diversity, and genetic diversity of inherent microbial communities. These studies help to understand the metabolic pathways and biodegradation patterns in the subsurface, however, the interspecies microbial interactions and their transport mechanism in the porous media toward bioremediation of subsurface pollutants are still not well understood. Despite the advanced characterization methods for microbes, multiple crucial knowledge gaps of the dynamic subsurface microbial community remain unraveled. A detailed understanding of subsurface microbial interactions, mineral-metal-microbial correlation, transport mechanism, and degradation pathways will help in the optimization and design of in-situ bioremediation in the future. There is a need for detail-oriented exploration of these fundamental microbial processes to gain a greater understanding of microbial dynamics to facilitate the advanced bioremediation processes sustainably.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0020,006
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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