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Enregistrement W4285677454 · doi:10.1101/2022.07.15.500213

Mouse and cellular models of <i>KPTN</i> -related disorder implicate mTOR signalling in cognitive and progressive overgrowth phenotypes

2022· preprint· en· W4285677454 sur OpenAlexaff
Maria O. Levitin, Lettie E. Rawlins, Gabriela Sánchez-Andrade, Osama A. Arshad, Stephan C. Collins, Stephen J. Sawiak, Philip H. Iffland, Malin H. L. Andersson, Caleb Bupp, Emma L. Cambridge, Eve L. Coomber, Ian O. Ellis, Johanna C. Herkert, Holly Ironfield, Logan Jory, Perrine F. Kretz, Sarina G. Kant, Alexandra Neaverson, Esther Nibbeling, Christine Rowley, Emily Relton, Mark Sanderson, Ethan M. Scott, Helen Stewart, Andrew Y. Shuen, John M. Schreiber, Elizabeth Tuck, James Tonks, Thorkild Terkelsen, Conny M.A. van Ravenswaaij‐Arts, Pradeep Vasudevan, Olivia Wenger, Michael Wright, Andrew T. Day, Adam Hunter, Minal Patel, Christopher J. Lelliott, Peter B. Crino, Binnaz Yalcin, Andrew H. Crosby, Emma L. Baple, Darren W. Logan, Matthew E. Hurles, Sebastian S. Gerety

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la RechercheNewlife the Charity for Disabled Children
Mots-clésmTORC1PI3K/AKT/mTOR pathwayPhenotypeMechanistic target of rapamycinBiologyNeuroscienceKnockout mouseCognitionPathologicalSignal transductionGeneticsInternal medicineMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract KPTN -related disorder (KRD) is an autosomal recessive disorder associated with germline variants in KPTN ( kaptin ), a component of the mTOR regulatory complex KICSTOR. To gain further insights into the pathogenesis of KRD, we analysed mouse knockout and human stem cell KPTN loss-of-function models. Kptn −/− mice display many of the key KRD phenotypes, including brain overgrowth, behavioural abnormalities, and cognitive deficits. Assessment of affected individuals has identified concordant selectivity of cognitive deficits, postnatal onset of brain overgrowth, and a previously unrecognised KPTN dosage-sensitivity, resulting in increased head circumference in their heterozygous parents. Molecular and structural analysis of Kptn −/− mice revealed pathological changes, including differences in brain size, shape, and cell numbers primarily due to abnormal postnatal brain development. Both the mouse and differentiated iPSC models of the disorder display transcriptional and biochemical evidence for altered mTOR pathway signalling, supporting the role of KPTN in regulating mTORC1. Increased mTOR signalling downstream of KPTN is rapamycin sensitive, highlighting possible therapeutic avenues with currently available mTOR inhibitors. These findings place KRD in the broader group of mTORC1 related disorders affecting brain structure, cognitive function, and network integrity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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