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Enregistrement W4285731053 · doi:10.1038/s41375-022-01641-x

PARP14 is a novel target in STAT6 mutant follicular lymphoma

2022· article· en· W4285731053 sur OpenAlexaff
Michael Mentz, William Keay, Carolin Dorothea Strobl, Martina Antoniolli, Louisa Adolph, Michael Heide, Axel Lechner, Sarah Haebe, Elisa Osterode, Robert Kridel, Christoph Ziegenhain, Lucas E. Wange, Johannes Adrian Hildebrand, Tanaya Shree, Elisabeth Silkenstedt, Annette M. Staiger, German Ott, Heike Horn, Monika Szczepanowski, Julia Richter, Ronald Levy, Andreas Rosenwald, Wolfgang Enard, Ursula Zimber‐Strobl, Michael von Bergwelt‐Baildon, Wolfgang Hiddemann, Marc Schmidt‐Supprian, Martina Rudelius, Deepak Bararia, Verena Passerini, Oliver Weigert

Notice bibliographique

RevueLeukemia · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteDeutschen Konsortium für Translationale KrebsforschungElse Kröner-Fresenius-StiftungDeutsche ForschungsgemeinschaftDeutsche KrebshilfeAmgen
Mots-clésBiologyChromatin immunoprecipitationTransactivationFollicular lymphomaDownregulation and upregulationMolecular biologyCell biologyGene expressionCancer researchPromoterLymphomaGeneImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The variable clinical course of follicular lymphoma (FL) is determined by the molecular heterogeneity of tumor cells and complex interactions within the tumor microenvironment (TME). IL-4 producing follicular helper T cells (T FH ) are critical components of the FL TME. Binding of IL-4 to IL-4R on FL cells activates JAK/STAT signaling. We identified STAT6 mutations ( STAT6 MUT ) in 13% of FL ( N = 33/258), all clustered within the DNA binding domain. Gene expression data and immunohistochemistry showed upregulation of IL-4/STAT6 target genes in STAT6 MUT FL, including CCL17 , CCL22 , and FCER2 (CD23). Functionally, STAT6 MUT was gain-of-function by serial replating phenotype in pre-B CFU assays. Expression of STAT6 MUT enhanced IL-4 induced FCER2 /CD23, CCL17 and CCL22 expression and was associated with nuclear accumulation of pSTAT6. RNA sequencing identified PARP14 -a transcriptional switch and co-activator of STAT6- among the top differentially upregulated genes in IL-4 stimulated STAT6 MUT lymphoma cells and in STAT6 MUT primary FL cells. Quantitative chromatin immunoprecipitation (qChIP) demonstrated binding of STAT6 MUT but not STAT6 WT to the PARP14 promotor. Reporter assays showed increased IL-4 induced transactivation activity of STAT6 MUT at the PARP14 promotor, suggesting a self-reinforcing regulatory circuit. Knock-down of PARP14 or PARP-inhibition abrogated the STAT6 MUT gain-of-function phenotype. Thus, our results identify PARP14 as a novel therapeutic target in STAT6 MUT FL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,829
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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