The amino acid sensor GCN2 suppresses terminal oligopyrimidine (TOP) mRNA translation via La-related protein 1 (LARP1)
Notice bibliographique
Résumé
La-related protein 1 (LARP1) has been identified as a key translational inhibitor of terminal oligopyrimidine (TOP) mRNAs downstream of the nutrient sensing protein kinase complex, mTORC1. LARP1 exerts this inhibitory effect on TOP mRNA translation by binding to the mRNA cap and the adjacent 5'TOP motif, resulting in the displacement of the cap-binding protein eIF4E from TOP mRNAs. However, the involvement of additional signaling pathway in regulating LARP1-mediated inhibition of TOP mRNA translation is largely unexplored. In the present study, we identify a second nutrient sensing kinase GCN2 that converges on LARP1 to control TOP mRNA translation. Using chromatin-immunoprecipitation followed by massive parallel sequencing (ChIP-seq) analysis of activating transcription factor 4 (ATF4), an effector of GCN2 in nutrient stress conditions, in WT and GCN2 KO mouse embryonic fibroblasts, we determined that LARP1 is a GCN2-dependent transcriptional target of ATF4. Moreover, we identified GCN1, a GCN2 activator, participates in a complex with LARP1 on stalled ribosomes, suggesting a role for GCN1 in LARP1-mediated translation inhibition in response to ribosome stalling. Therefore, our data suggest that the GCN2 pathway controls LARP1 activity via two mechanisms: ATF4-dependent transcriptional induction of LARP1 mRNA and GCN1-mediated recruitment of LARP1 to stalled ribosomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».