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Enregistrement W4286488094 · doi:10.3389/fevo.2022.923967

Altitudinal Patterns in Adaptive Evolution of Genome Size and Inter-Genome Hybridization Between Three Elymus Species From the Qinghai–Tibetan Plateau

2022· article· en· W4286488094 sur OpenAlexaff
Zhao Chen, Yongzhuo Guan, Mengli Han, Yuxia Guo, Jingxue Zhang, Zhipeng Guo, Genlou Sun, Xuebing Yan

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Ecology and Evolution · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensSaint Mary's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyElymusTriticeaeGenome sizeGenomePopulationIntraspecific competitionPolyploidEvolutionary biologyPloidyGeneticsBotanyZoologyPoaceaeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genome size variation and hybridization occur frequently within or between plant species under diverse environmental conditions, which enrich species diversification and drive the evolutionary process. Elymus L. is the largest genus in Triticeae with five recognized basic genomes (St, H, P, W, and Y). However, the data on population cytogenetics of Elymus species are sparse, especially whether genome hybridization and chromosomal structure can be affected by altitude are still unknown. In order to explore the relationship between genome sizes, we studied interspecific hybridization and altitude of Elymus species at population genetic and cytological levels. Twenty-seven populations at nine different altitudes (2,800–4,300 m) of three Elymus species, namely, hexaploid E. nutans (StHY, 2n = 6x = 42), tetraploid E. burchan-buddae (StY, 2n = 4x = 28), and E. sibiricus (StH, 2n = 4x = 28), were sampled from the Qinghai–Tibetan Plateau (QTP) to estimate whether intraspecific variation could affect the genomic relationships by genomic in situ hybridization (GISH), and quantify the genome size of Elymus among different altitude ecological groups by flow cytometry. The genome size of E. nutans, E. burchan-buddae , and E. sibiricus varied from 12.38 to 22.33, 8.81 to 18.93, and 11.46 to 20.96 pg/2C with the averages of 19.59, 12.39, and 16.85 pg/2C, respectively. The curve regression analysis revealed a strong correlation between altitude and nuclear DNA content in three Elymus species. In addition, the chromosomes of the St and Y genomes demonstrated higher polymorphism than that of the H genome. Larger genome size variations occurred in the mid-altitude populations (3,900–4,300 m) compared with other-altitude populations, suggesting a notable altitudinal pattern in genome size variation, which shaped genome evolution by altitude. This result supports our former hypothesis that genetic richness center at medium altitude is useful and valuable for species adaptation to highland environmental conditions, germplasm utilization, and conservation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,784

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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