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Enregistrement W4286669170 · doi:10.1101/2022.07.21.501057

Hybrid Rank Aggregation (HRA): A novel rank aggregation method for ensemble-based feature selection

2022· preprint· en· W4286669170 sur OpenAlexafffund
Rahi Jain, Wei Xu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueAdvanced Statistical Methods and Models
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaProstate Cancer Canada
Mots-clésFeature selectionCategorical variableComputer scienceFeature (linguistics)Selection (genetic algorithm)Rank (graph theory)Artificial intelligenceData miningMachine learningPattern recognition (psychology)Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Feature selection (FS) reduces the dimensions of high dimensional data. Among many FS approaches, ensemble-based feature selection (EFS) is one of the commonly used approaches. The rank aggregation (RA) step influences the feature selection of EFS. Currently, the EFS approach relies on using a single RA algorithm to pool feature performance and select features. However, a single RA algorithm may not always give optimal performance across all datasets. Method and Results This study proposes a novel hybrid rank aggregation (HRA) method to perform the RA step in EFS which allows the selection of features based on their importance across different RA techniques. The approach allows creation of a RA matrix which contains feature performance or importance in each RA technique followed by an unsupervised learning-based selection of features based on their performance/importance in RA matrix. The algorithm is tested under different simulation scenarios for continuous outcomes and several real data studies for continuous, binary and time to event outcomes and compared with existing RA methods. The study found that HRA provided a better or at par robust performance as compared to existing RA methods in terms of feature selection and predictive performance of the model. Conclusion HRA is an improvement to current single RA based EFS approaches with better and robust performance. The consistent performance in continuous, categorical and time to event outcomes suggest the wide applicability of this method. While the current study limits the testing of HRA on cross-sectional data with input features of a continuous distribution, it could be applied to longitudinal and categorical data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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