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Enregistrement W4286716116 · doi:10.1101/2022.07.20.500906

HfaE is a component of the holdfast anchor complex that tethers the holdfast adhesin to the cell envelope

2022· preprint· en· W4286716116 sur OpenAlexafffund
Nelson K. Chepkwony, Gail G. Hardy, Yves V. Brun

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésHoldfastBacterial adhesinCell biologyMutantBiologySecretionChemistryBiochemistryVirulenceBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Bacteria use adhesins to colonize different surfaces and form biofilms. The species of the Caulobacterales order use a polar adhesin called holdfast, composed of polysaccharides, proteins, and DNA to irreversibly adhere to surfaces. In C. crescentus, a freshwater Caulobacterales, the holdfast is anchored at the cell pole via the h oldfast a nchor (Hfa) proteins HfaA, HfaB, and HfaD. HfaA and HfaD co-localize with holdfast and are thought to form amyloid-like fibers that anchor holdfast to the cell envelope. HfaB, a lipoprotein, is required for translocation of HfaA and HfaD to the cell surface. Deletion of the anchor proteins leads to a severe defect in adherence resulting from holdfast not properly attached to the cell and shed into the medium. This phenotype is greater in a Δ hfaB than a double Δ hfaA hfaD mutant, suggesting that HfaB has other functions besides the translocation of HfaA and HfaD. Here, we identify an additional HfaB-dependent holdfast anchoring protein, HfaE, which is predicted to be a secreted protein. HfaE is highly conserved among Caulobacterales species with no predicted function. In planktonic culture, hfaE mutants produce holdfasts and rosettes similar to wild type. However, holdfasts from hfaE mutants bind to the surface but are unable to anchor cells, similar to other anchor mutants. We showed that fluorescently-tagged HfaE co-localizes with holdfast, and HfaE forms an SDS-resistant high molecular weight species consistent with amyloid fiber formation. We propose that HfaE is a novel holdfast anchor protein, and that HfaE functions to link holdfast material to the cell envelope. IMPORTANCE For surface attachment and biofilm formation, bacteria produce adhesins that are composed of polysaccharides, proteins and DNA. Species in the Caulobacterales produce a specialized polar adhesin, holdfast, which is required for permanent attachment to surfaces. In this study, we evaluate the role of a newly identified holdfast anchor protein HfaE in holdfast anchoring to the cell surface in two different Caulobacterales with drastically different environments. We show that HfaE plays an important role in adhesion and biofilm formation in Caulobacterales. Our results provide insights into bacterial adhesins and how they interact with the cell envelope and surfaces.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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