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Enregistrement W4287377570 · doi:10.1111/pcmr.13058

Landscape of mutations in early stage primary cutaneous melanoma: An <scp>InterMEL</scp> study

2022· article· en· W4287377570 sur OpenAlexaff
Li Luo, Ronglai Shen, Arshi Arora, Irene Orlow, Klaus J. Busam, Cecilia Lezcano, Tim K. Lee, Eva Hernando, Ivan Gorlov, Christopher I. Amos, Marc S. Ernstoff, Venkatraman Seshan, Anne Ε. Cust, James S. Wilmott, Richard A. Scolyer, Graham J. Mann, Eduardo Nagore, Pauline Funchain, Jennifer S. Ko, Peter Ngo, Sharon N. Edmiston, Kathleen Conway, Paul B. Googe, David W. Ollila, Jeffrey E. Lee, Shenying Fang, Judy R. Rees, Cheryl L. Thompson, Meg R. Gerstenblith, Marcus Bosenberg, Bonnie Gould Rothberg, Iman Osman, Yvonne M. Saenger, Adam Z. Reynolds, Matthew Schwartz, Tawny W. Boyce, Sheri L. Holmen, Elise K. Brunsgaard, Paul N. Bogner, Pei Fen Kuan, Charles L. Wiggins, Nancy E. Thomas, Colin B. Begg, Marianne Berwick

Notice bibliographique

RevuePigment Cell & Melanoma Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCutaneous Melanoma Detection and Management
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterNational Institute of Environmental Health SciencesLineberger Comprehensive Cancer Center, University of North Carolina at Chapel HillNational Institute of General Medical SciencesNational Health and Medical Research CouncilUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterRoswell Park Alliance Foundation, Roswell Park Cancer InstituteChar and Chuck Fowler Family FoundationNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCleveland Foundation
Mots-clésNeuroblastoma RAS viral oncogene homologCDKN2AMelanomaPerineural invasionGNAQCancer researchMedicineStage (stratigraphy)PathologyBiologyMutationKRASInternal medicineCancerGeneGeneticsColorectal cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is unclear why some melanomas aggressively metastasize while others remain indolent. Available studies employing multi-omic profiling of melanomas are based on large primary or metastatic tumors. We examine the genomic landscape of early-stage melanomas diagnosed prior to the modern era of immunological treatments. Untreated cases with Stage II/III cutaneous melanoma were identified from institutions throughout the United States, Australia and Spain. FFPE tumor sections were profiled for mutation, methylation and microRNAs. Preliminary results from mutation profiling and clinical pathologic correlates show the distribution of four driver mutation sub-types: 31% BRAF; 18% NRAS; 21% NF1; 26% Triple Wild Type. BRAF mutant tumors had younger age at diagnosis, more associated nevi, more tumor infiltrating lymphocytes, and fewer thick tumors although at generally more advanced stage. NF1 mutant tumors were frequent on the head/neck in older patients with severe solar elastosis, thicker tumors but in earlier stages. Triple Wild Type tumors were predominantly male, frequently on the leg, with more perineural invasion. Mutations in TERT, TP53, CDKN2A and ARID2 were observed often, with TP53 mutations occurring particularly frequently in the NF1 sub-type. The InterMEL study will provide the most extensive multi-omic profiling of early-stage melanoma to date. Initial results demonstrate a nuanced understanding of the mutational and clinicopathological landscape of these early-stage tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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