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Enregistrement W4287838589 · doi:10.1073/pnas.2204539119

SARS-CoV-2 impairs interferon production via NSP2-induced repression of mRNA translation

2022· article· en· W4287838589 sur OpenAlexafffund
Xu Zhang, Jung‐Hyun Choi, David L. Dai, Jun Luo, Reese Jalal Ladak, Qian Li, Yimeng Wang, Christine Zhang, Shane Wiebe, Alex C.H. Liu, Xiaozhuo Ran, Jiaqi Yang, Parisa Naeli, Aitor Garzia, Lele Zhou, Niaz Mahmood, Qiyun Deng, Mohamed Elaish, Rongtuan Lin, Lara K. Mahal, Tom C. Hobman, Jerry Pelletier, Tommy Alain, Silvia M. Vidal, Thomas F. Duchaîne, Mohammad T. Mazhab‐Jafari, Xiaojuan Mao, Seyed Mehdi Jafarnejad, Nahum Sonenberg

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMcGill Genome CentreUniversity of OttawaUniversity of AlbertaChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill UniversityChristie (Canada)University of ManitobaPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchChina Scholarship CouncilQueen's UniversityDirectorate for Biological SciencesTerry Fox Research InstituteNational Research Foundation of KoreaCanada Excellence Research Chairs, Government of CanadaUK Research and InnovationNational Research FoundationQueen's University BelfastGovernment of CanadaPrincess Margaret Cancer Foundation
Mots-clésInnate immune systemMessenger RNATranslation (biology)InterferonBiologyCell biologyPsychological repressionImmune systemVirologyRNAProtein biosynthesismicroRNAViral replicationMechanism (biology)CytokineVirusImmunologyGene expressionMolecular biologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Viruses evade the innate immune response by suppressing the production or activity of cytokines such as type I interferons (IFNs). Here we report the discovery of a mechanism by which the SARS-CoV-2 virus coopts an intrinsic cellular machinery to suppress the production of the key immunostimulatory cytokine IFN-β. We reveal that the SARS-CoV-2 encoded nonstructural protein 2 (NSP2) directly interacts with the cellular GIGYF2 protein. This interaction enhances the binding of GIGYF2 to the mRNA cap-binding protein 4EHP, thereby repressing the translation of the Ifnb1 mRNA. Depletion of GIGYF2 or 4EHP significantly enhances IFN-β production, which inhibits SARS-CoV-2 replication. Our findings reveal a target for rescuing the antiviral innate immune response to SARS-CoV-2 and other RNA viruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,249

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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