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Enregistrement W4288069250 · doi:10.3138/jammi-2021-0026

Evaluation of the performance of multiple immunoassay diagnostic platforms on the National Microbiology Laboratory SARS-CoV-2 National Serology Panel

2022· article· en· W4288069250 sur OpenAlexaffvenueabout
Antonia Dibernardo, Nikki PL Toledo, Alyssia Robinson, Carla Osiowy, Elizabeth Giles, Jacqueline Day, L. Robbin Lindsay, Michael Drebot, Timothy F. Booth, Tamara Pidduck, Ashley Baily, Carmen Charlton, Graham Tipples, Jamil N. Kanji, Gino Brochu, Amanda Lang, Christian Therrien, Mélina Bélanger-Collard, Sylvie-Nancy Beaulac, Brian M. Gilfix, Guy Boivin, Marie‐Ève Hamelin, Julie Carbonneau, Simon Lévesque, Philippe Martin, Andrés Finzi, Gabrielle Gendron‐Lepage, Guillaume Goyette, Mehdi Benlarbi, Romain Gasser, Claude Fortin, Valérie Martel-Lafferrière, Myriam Lavoie, Renée Guérin, Louis‐Patrick Haraoui, Christian Renaud, Craig Jenkins, Sheila F. O’Brien, Steven J. Drews, Valerie Conrod, Vanessa Tran, Bill Awrey, R. Scheuermann, Alan P. Dupuis, Anne F. Payne, Casey Warszycki, Roxie C. Girardin, William Lee, George Zahariadis, Lei Jiao, Robert Needle, James Cordenbach, Jerry Zaharatos, Kellee Taylor, Marty Teltscher, Matthew Miller, May ElSherif, Peter K. J. Robertson, Jason L. Robinson

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensHealth PEIDalhousie UniversityJewish General HospitalGovernment of Newfoundland and LabradorAlpha Cancer TechnologiesPublic Health OntarioNewfoundland and Labrador Centre for Applied Health ResearchCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineCanadian Blood ServicesUniversité de MontréalUniversity of Alberta HospitalCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanUniversity of TorontoUniversité de SherbrookeSaskatchewan Health AuthorityCentre Hospitalier de l’Université de MontréalUniversité LavalCentre intégré universitaire de santé et de services sociaux de la Mauricie-et-du-Centre-du-QuébecCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-MontréalMcGill UniversityPublic Health Agency of CanadaMcGill University Health CentreInstitut National de Santé Publique du QuébecAlpha Technologies (Canada)Saskatchewan HealthUniversity of CalgaryUniversity of AlbertaCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeAlberta Hospital EdmontonBC Centre for Disease Control
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerologySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)MedicineRoche DiagnosticsImmunoassayCoronavirus disease 2019 (COVID-19)VirologyAntibodyImmunologyInternal medicineInfectious disease (medical specialty)Disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Serological assays designed to detect SARS-CoV-2 antibodies are being used in serological surveys and other specialized applications. As a result, and to ensure that the outcomes of serological testing meet high quality standards, evaluations are required to assess the performance of these assays and the proficiency of laboratories performing them. METHODS: A panel of 60 plasma/serum samples from blood donors who had reverse transcriptase–polymerase chain reaction (RT-PCR) confirmed SARS-CoV-2 infections and 21 SARS-CoV-2 negative samples were secured and distributed to interested laboratories within Canada ( n = 30) and the United States ( n = 1). Participating laboratories were asked to provide details on the diagnostic assays used, the platforms the assays were performed on, and the results obtained for each panel sample. Laboratories were blinded with respect to the expected outcomes. RESULTS: The performance of the different assays evaluated was excellent, with the high-throughput platforms of Roche, Ortho, and Siemens demonstrating 100% sensitivity. Most other high-throughput platforms had sensitivities of >93%, with the exception of the IgG assay using the Abbott ARCHITECT which had an average sensitivity of only 87%. The majority of the high-throughput platforms also demonstrated very good specificities (>97%). CONCLUSION: This proficiency study demonstrates that most of the SARS-CoV-2 serological assays utilized by provincial public health or hospital laboratories in Canada have acceptable sensitivity and excellent specificity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,156
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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