Sulfur and methane oxidation by a single microorganism
Notice bibliographique
Résumé
Natural and anthropogenic wetlands are major sources of the atmospheric greenhouse gas methane. Methane emissions from wetlands are mitigated by methanotrophic bacteria at the oxic–anoxic interface, a zone of intense redox cycling of carbon, sulfur, and nitrogen compounds. Here, we report on the isolation of an aerobic methanotrophic bacterium, ‘ Methylovirgula thiovorans ' strain HY1, which possesses metabolic capabilities never before found in any methanotroph. Most notably, strain HY1 is the first bacterium shown to aerobically oxidize both methane and reduced sulfur compounds for growth. Genomic and proteomic analyses showed that soluble methane monooxygenase and XoxF-type alcohol dehydrogenases are responsible for methane and methanol oxidation, respectively. Various pathways for respiratory sulfur oxidation were present, including the Sox–rDsr pathway and the S 4 I system. Strain HY1 employed the Calvin–Benson–Bassham cycle for CO 2 fixation during chemolithoautotrophic growth on reduced sulfur compounds. Proteomic and microrespirometry analyses showed that the metabolic pathways for methane and thiosulfate oxidation were induced in the presence of the respective substrates. Methane and thiosulfate could therefore be independently or simultaneously oxidized. The discovery of this versatile bacterium demonstrates that methanotrophy and thiotrophy are compatible in a single microorganism and underpins the intimate interactions of methane and sulfur cycles in oxic–anoxic interface environments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».