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Enregistrement W4289654240 · doi:10.1002/mds.29157

Epigenetic Clock Acceleration Is Linked to Age at Onset of Parkinson's Disease

2022· article· en· W4289654240 sur OpenAlexafffund
Xuelin Tang, Paulina González-Latapí, Connie Marras, Naomi P. Visanji, Wanli Yang, Christine Sato, Anthony E. Lang, Ekaterina Rogaeva, Ming Zhang

Notice bibliographique

RevueMovement Disorders · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensOntario Brain InstituteUniversity of TorontoOccupational Cancer Research CentreToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of ChinaFundamental Research Funds for the Central UniversitiesConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissement
Mots-clésdNaMCohortProportional hazards modelHazard ratioMedicineAge of onsetCohort studyInternal medicineDemographyOncologyPediatricsDiseaseBiologyGeneticsConfidence intervalDNA methylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Aging is the strongest risk factor for Parkinson's disease (PD), which is a clinically heterogeneous movement disorder with highly variable age at onset. DNA methylation age (DNAm age) is an epigenetic clock that could reflect biological aging. Objectives The aim was to evaluate whether PD age at onset is associated with DNAm‐age acceleration (difference between DNAm age and chronological age). Methods We used the genome‐wide Infinium MethylationEPIC array to assess DNAm age in discovery ( n = 96) and replication ( n = 182) idiopathic PD cohorts and a unique longitudinal LRRK2 cohort ( n = 220) at four time points over a 3‐year period, comprising 91 manifesting and 129 nonmanifesting G2019S carriers at baseline. Cox proportional hazard regression and multivariate linear regression were used to evaluate the relation between DNAm‐age acceleration and PD age at onset, which was highly variable in manifesting G2019S carriers (36–75 years) and both idiopathic PD cohorts (26–77 and 35–81 years). Results DNAm‐age acceleration remained steady over the 3‐year period in most G2019S carriers. It was strongly associated with age at onset in the LRRK2 cohort ( P = 2.25 × 10 −15 ) and discovery idiopathic PD cohort ( P = 5.39 × 10 −9 ), suggesting that every 5‐year increase in DNAm‐age acceleration is related to about a 6‐year earlier onset. This link was replicated in an independent idiopathic PD cohort ( P = 1.91 × 10 −10 ). In each cohort, the faster‐aging group has an increased hazard for an earlier onset (up to 255%). Conclusions This study is the first to demonstrate that DNAm‐age acceleration is related to PD age at onset, which could be considered in disease‐modifying clinical trials. Future studies should evaluate the stability of DNAm‐age acceleration over longer time periods, especially for phenoconverters from nonmanifesting to manifesting individuals. © 2022 International Parkinson and Movement Disorder Society.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,121
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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