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Enregistrement W4289687832 · doi:10.1186/s41512-022-00128-8

Development and validation of prognostic models for anal cancer outcomes using distributed learning: protocol for the international multi-centre atomCAT2 study

2022· article· en· W4289687832 sur OpenAlex
Stelios Theophanous, Per-Ivar Lønne, Ananya Choudhury, Maaike Berbée, André Dekker, Kristopher Dennis, Alice Dewdney, Maria Antonietta Gambacorta, Alexandra Gilbert, Marianne G. Guren, Lois Holloway, Rashmi Jadon, Rohit Kochhar, Ahmed Allam Mohamed, R. Muirhead, Oriol Parés, Łukasz Raszewski, Rajarshi Roy, Andrew Scarsbrook, David Sebag‐Montefiore, Emiliano Spezi, Karen‐Lise Garm Spindler, Baukelien van Triest, Vassilios S. Vassiliou, Eirik Malinen, Leonard Wee, Ane Appelt, Richard Adams, Muhammad Amin, Nikola Dino Capocchiano, Peter S. Colley, Andrea Damiani, Viola De Luca, Charlotte Deijen, Antri Demetriou, Michael J. Eble, Matthew Field, Loukia Georgiou, Ann Henry, Joanna Lau, Mark Lee, J. Lilley, Patrícia Lopes, Christina Maria Lutz, S. Manfrida, J. Marsden, Carlotta Masciocchi, Joseph Mercer, Lars Nyvang, Elisavet Papageorgiou, Gareth Price, Thomas Rackley, Mariachiara Savino, J. Stroom, Ioannis M. Stylianou, Nilesh Tambe, David Thwaites, Maciej Trojanowski, Vincenzo Valentini, Sandra Vieira

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueDiagnostic and Prognostic Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal and Anal Carcinomas
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesHanarth FondsYorkshire Cancer ResearchNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekAcademy of Medical SciencesNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UK
Mots-clésAnal cancerMedicineProtocol (science)ChemoradiotherapyCohortCancerMedical physicsOncologyInternal medicinePathologyAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Anal cancer is a rare cancer with rising incidence. Despite the relatively good outcomes conferred by state-of-the-art chemoradiotherapy, further improving disease control and reducing toxicity has proven challenging. Developing and validating prognostic models using routinely collected data may provide new insights for treatment development and selection. However, due to the rarity of the cancer, it can be difficult to obtain sufficient data, especially from single centres, to develop and validate robust models. Moreover, multi-centre model development is hampered by ethical barriers and data protection regulations that often limit accessibility to patient data. Distributed (or federated) learning allows models to be developed using data from multiple centres without any individual-level patient data leaving the originating centre, therefore preserving patient data privacy. This work builds on the proof-of-concept three-centre atomCAT1 study and describes the protocol for the multi-centre atomCAT2 study, which aims to develop and validate robust prognostic models for three clinically important outcomes in anal cancer following chemoradiotherapy. METHODS: This is a retrospective multi-centre cohort study, investigating overall survival, locoregional control and freedom from distant metastasis after primary chemoradiotherapy for anal squamous cell carcinoma. Patient data will be extracted and organised at each participating radiotherapy centre (n = 18). Candidate prognostic factors have been identified through literature review and expert opinion. Summary statistics will be calculated and exchanged between centres prior to modelling. The primary analysis will involve developing and validating Cox proportional hazards models across centres for each outcome through distributed learning. Outcomes at specific timepoints of interest and factor effect estimates will be reported, allowing for outcome prediction for future patients. DISCUSSION: The atomCAT2 study will analyse one of the largest available cross-institutional cohorts of patients with anal cancer treated with chemoradiotherapy. The analysis aims to provide information on current international clinical practice outcomes and may aid the personalisation and design of future anal cancer clinical trials through contributing to a better understanding of patient risk stratification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,302
Score d'incertitude au seuil0,539

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,269
Tête enseignante GPT0,461
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle