MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4290660012 · doi:10.1038/s41467-022-32386-x

Allosteric modulation of GPCR-induced β-arrestin trafficking and signaling by a synthetic intrabody

2022· article· en· W4290660012 sur OpenAlexafffund
Mithu Baidya, Madhu Chaturvedi, Hemlata Dwivedi‐Agnihotri, Ashutosh Ranjan, Dominic Devost, Yoon Namkung, Tomasz Maciej Stępniewski, Shubhi Pandey, Minakshi Baruah, Bhanupriya Panigrahi, Parishmita Sarma, Manish K. Yadav, Jagannath Maharana, Ramanuj Banerjee, Kouki Kawakami, Asuka Inoue, Jana Selent, Stéphane A. Laporte, Terence E. Hébert, Arun K. Shukla

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesDaiichi Sankyo EuropeMoonshot Research and Development ProgramInstituto de Salud Carlos IIIScience and Engineering Research BoardJapan Society for the Promotion of ScienceWellcome TrustCouncil of Scientific and Industrial Research, IndiaDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaMinisterio de Economía y CompetitividadIndian Institute of Technology KanpurGovernment of CanadaThe Wellcome Trust DBT India AllianceJapan Science and Technology AgencyDaiichi Sankyo Foundation of Life ScienceCanadian Institutes of Health ResearchUehara Memorial Foundation
Mots-clésG protein-coupled receptorEndosomeArrestinPhosphorylationAllosteric regulationInternalizationCell biologyEffectorBiologyReceptorAgonistSignal transductionChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Agonist-induced phosphorylation of G protein-coupled receptors (GPCRs) is a primary determinant of β-arrestin (βarr) recruitment and trafficking. For several GPCRs such as the vasopressin receptor subtype 2 (V 2 R), agonist-stimulation first drives the translocation of βarrs to the plasma membrane, followed by endosomal trafficking, which is generally considered to be orchestrated by multiple phosphorylation sites. We have previously shown that mutation of a single phosphorylation site in the V 2 R (i.e., V 2 R T360A ) results in near-complete loss of βarr translocation to endosomes despite robust recruitment to the plasma membrane, and compromised ERK1/2 activation. Here, we discover that a synthetic intrabody (Ib30), which selectively recognizes activated βarr1, efficiently rescues the endosomal trafficking of βarr1 and ERK1/2 activation for V 2 R T360A . Molecular dynamics simulations reveal that Ib30 enriches active-like βarr1 conformation with respect to the inter-domain rotation, and cellular assays demonstrate that it also enhances βarr1-β 2 -adaptin interaction. Our data provide an experimental framework to positively modulate the receptor-transducer-effector axis for GPCRs using intrabodies, which can be potentially integrated in the paradigm of GPCR-targeted drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil0,327

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetReceptor Mechanisms and SignalingTravaux en français237 207