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Enregistrement W4290852318 · doi:10.1126/sciimmunol.abn3800

Immunodeficiency, autoimmunity, and increased risk of B cell malignancy in humans with <i>TRAF3</i> mutations

2022· article· en· W4290852318 sur OpenAlexaff
William Rae, John M. Sowerby, Dorit Verhoeven, Mariam M. Youssef, Prasanti Kotagiri, Natalia Savinykh, Eve L. Coomber, Alexis Boneparth, Angela Chan, Chun Gong, Machiel H. Jansen, Romy du Long, Giorgia Santilli, Ilenia Simeoni, Jonathan Stephens, Kejia Wu, Marta Zinicola, Hana Lango Allen, Helen Baxendale, Dinakantha Kumararatne, Effrossyni Gkrania‐Klotsas, Selma Scheffler‐Mendoza, Marco Antonio Yamazaki‐Nakashimada, Laura Berrón‐Ruiz, Cesar Mauricio Rojas‐Maruri, Saúl Oswaldo Lugo Reyes, Paul Lyons, Anthony P. Williams, Daniel J. Hodson, Gail A. Bishop, Adrian J. Thrasher, David Thomas, Michael P. Murphy, Timothy J. Vyse, Joshua D. Milner, Taco W. Kuijpers, Kenneth G. C. Smith

Notice bibliographique

RevueScience Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésImmunologyBiologyAutoimmunityB cellTumor necrosis factor alphaImmune systemImmune dysregulationCancer researchAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tumor necrosis factor receptor–associated factor 3 (TRAF3) is a central regulator of immunity. TRAF3 is often somatically mutated in B cell malignancies, but its role in human immunity is not defined. Here, in five unrelated families, we describe an immune dysregulation syndrome of recurrent bacterial infections, autoimmunity, systemic inflammation, B cell lymphoproliferation, and hypergammaglobulinemia. Affected individuals each had monoallelic mutations in TRAF3 that reduced TRAF3 expression. Immunophenotyping showed that patients’ B cells were dysregulated, exhibiting increased nuclear factor-κB 2 activation, elevated mitochondrial respiration, and heightened inflammatory responses. Patients had mild CD4 + T cell lymphopenia, with a reduced proportion of naïve T cells but increased regulatory T cells and circulating T follicular helper cells. Guided by this clinical phenotype, targeted analyses demonstrated that common genetic variants, which also reduce TRAF3 expression, are associated with an increased risk of B cell malignancies, systemic lupus erythematosus, higher immunoglobulin levels, and bacterial infections in the wider population. Reduced TRAF3 conveys disease risks by driving B cell hyperactivity via intrinsic activation of multiple intracellular proinflammatory pathways and increased mitochondrial respiration, with a likely contribution from dysregulated T cell help. Thus, we define monogenic TRAF3 haploinsufficiency syndrome and demonstrate how common TRAF3 variants affect a range of human diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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