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Enregistrement W4291019073 · doi:10.4314/ejhs.v32i4.5

Screening of BRCA1 (c.5177_5180delGAAA rs80357867 and c.4986+6T>C rs80358086) and the BRCA2 (c.6445_6446delAT rs80359592) genes for breast cancer prevention in Burkina Faso

2022· article· en· W4291019073 sur OpenAlexaff
Isabelle Touwendpoulimdé Kiendrebeogo, Abdou Azaque Zouré, Fabienne I. Zongo, Serge Yannick Ouédraogo, Alexis Yobi Sawadogo, Jospin Amegnona, Herman Karim Sombié, Jean Telesphore Valerie Bazie, Endé A. Sorgho, Albert Théophane Yonli, Marie N. L. Ouedraogo, Dorcas Obiri‐Yeboah, Nayi Zongo, Hierrhum Aboubacar Bambara, Jacques Simporè

Notice bibliographique

RevueEthiopian Journal of Health Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensSt. Thomas University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerMedicineInternal medicineOdds ratioGenotypeConfidence intervalOncologyCancerGastroenterologyCase-control studyAlleleFamily historyPopulationGynecologyGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The objective of this study is to search for mutations in the BRCA1 (c.5177_5180delGAAA and c.4986+6T>C) and BRCA2 genes (c.6445_6446delAT) in a population of women diagnosed with breast cancer. Methods: This is a case-control study that involved 140 participants, including 70 patients with histologically diagnosed breast cancer and 70 healthy women without breast cancer. Mutations in the BRCA1 (rs80357867, rs80358086) and BRCA2 (rs80359592) genes were tested by real-time PCR. The 95% confidence interval Odds Ratio (OR) was used to estimate the associations between specific genotypes and breast cancer. Results: The study revealed that no mutations were detected for rs80359592. Similarly, no reference allele (TTTC/TTTC) of rs80357867 was found in this study. However, the homozygous double mutant (-/) genotype of this rs80357867 was observed in 11.43% and 1.43% of patients and controls respectively, while 88.57% of patients and 98.57% of controls had a heterozygous deletion (TTTC/-). Concerning rs80358086, 8.57% of the patients had a heterozygous mutation (A/G) with no significantly risk association with occurrence of breast cancer (OR = 6.46; 95% CI: 0.75-55.21; p = 0.11). In addition, this heterozygous mutation was significantly associated with a family history of breast cancer (OR=128; 95% CI: 9.46-1730.93) and breast cancer risk in nonmultiparous women (OR=6; 95% CI: 1-35.90; p= 0.05) but no association with overweight/obesity (OR=1.66; 95% CI: 0.18-15.35; p=1). Conclusion: This study shows high frequencies of heterozygous mutation of rs80357867 and rs80358086 from patients. In Burkina Faso, these results could help with early diagnosis of breast cancer in patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,777
Score d'incertitude au seuil0,496

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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