XPC–PARP complexes engage the chromatin remodeler ALC1 to catalyze global genome DNA damage repair
Notice bibliographique
Résumé
Cells employ global genome nucleotide excision repair (GGR) to eliminate a broad spectrum of DNA lesions, including those induced by UV light. The lesion-recognition factor XPC initiates repair of helix-destabilizing DNA lesions, but binds poorly to lesions such as CPDs that do not destabilize DNA. How difficult-to-repair lesions are detected in chromatin is unknown. Here, we identify the poly-(ADP-ribose) polymerases PARP1 and PARP2 as constitutive interactors of XPC. Their interaction results in the XPC-stimulated synthesis of poly-(ADP-ribose) (PAR) by PARP1 at UV lesions, which in turn enables the recruitment and activation of the PAR-regulated chromatin remodeler ALC1. PARP2, on the other hand, modulates the retention of ALC1 at DNA damage sites. Notably, ALC1 mediates chromatin expansion at UV-induced DNA lesions, leading to the timely clearing of CPD lesions. Thus, we reveal how chromatin containing difficult-to-repair DNA lesions is primed for repair, providing insight into mechanisms of chromatin plasticity during GGR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».