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Enregistrement W4291670402 · doi:10.1101/2022.08.09.503242

Disabling of ARC1 through CRISPR/CAS9 leads to a complete breakdown of self-incompatibility responses in <i>Brassica napus</i>

2022· preprint· en· W4291670402 sur OpenAlexaff
Kumar Abhinandan, Neil M.N. Hickerson, Xingguo Lan, Marcus A. Samuel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBrassicaceaeBrassicaMutantBiologyChemistryGeneticsBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Self-incompatibility (SI) is a genetic mechanism utilized by many flowering plants to promote outcrossing by recognizing and rejecting self-pollen. While the molecular mechanisms controlling SI can differ in various families, plants in the Brassicaceae family have been found to regulate SI through a S-haplotype-specific receptor-ligand interaction. The recognition of self-pollen leads to the activation of ARMADILLO-REPEAT-CONTAINING1 (ARC1), an E3 ligase which is thought to degrade the compatibility factors required for pollen germination, thus resulting in SI. However, the role of ARC1 in SI in the Brassicaceae family has been disputed within the scientific community. While various studies demonstrate that the manipulation of ARC1 and its downstream targets can break-down the SI response, others show that the SI phenotype can be imparted to self-compatible cultivars without the ARC1 gene. This study investigated the involvement of ARC1 in SI through the generation of loss-of-function ARC1 mutants using CRISPR-Cas9 in B. napus. Loss of ARC1 resulted in complete breakdown of SI in two different S-haplotypes providing strong evidence for the essential nature of ARC1 for mounting a successful SI response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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