Apolipoprotein E4 Prevalence in Different Canine Breeds
Notice bibliographique
Résumé
Three common isoforms of apolipoprotein E (APOE) are found in most populations: E2, E3, and E4, the Ε4 isoform has been proven to be associated with Alzheimer’s disease (AD) and coronary heart disease (CHD). In human, attributable risk due to APOE4 varies by region and by race/ethnicity. To gain a better understanding of APOE genetic polymorphism in canines, we aimed to explore the prevalence of apolipoprotein E isoform distribution in five different pure breeds (Thai Ridgeback, Golden Retriever, Labrador Retriever, Bulldog, Shih Tzu) using APOE gene sequencing analysis. Our results showed a very high homology of apolipoprotein E sequences in the examined canines, including human APOE3 and human APOE4, ranging from 71.76-100 and 78.23-100% identity and similarity, respectively. All investigated canine breeds could be identified as APOE4 carriers due to the presence of arginine at the positions 112 and 158, which correspond to APOE4 of human. This indicates that APOE polymorphism was not present in the genome of all examined canine breeds. It is possible that the finding of canine apolipoprotein E4 may be important in predicting an increased risk of pathophysiological development of neurodegenerative diseases and coronary heart disease. Our reconstructed phylogenetic tree showed two well-defined clusters based on the amino acid sequence of apolipoprotein E, including canine and human group. Further studies should explore if these different clusters are associated with diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».