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Enregistrement W4292209893 · doi:10.47278/journal.ijvs/2021.123

Apolipoprotein E4 Prevalence in Different Canine Breeds

2022· article· en· W4292209893 sur OpenAlexaboutno aff
Dechawut Bunyaluk, Wilasinee Srisanyong, Chalothon Amporn

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Veterinary Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApolipoprotein EApolipoprotein BGene isoformBiologyGeneticsDiseaseGeneInternal medicineMedicineEndocrinologyCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Three common isoforms of apolipoprotein E (APOE) are found in most populations: E2, E3, and E4, the Ε4 isoform has been proven to be associated with Alzheimer’s disease (AD) and coronary heart disease (CHD). In human, attributable risk due to APOE4 varies by region and by race/ethnicity. To gain a better understanding of APOE genetic polymorphism in canines, we aimed to explore the prevalence of apolipoprotein E isoform distribution in five different pure breeds (Thai Ridgeback, Golden Retriever, Labrador Retriever, Bulldog, Shih Tzu) using APOE gene sequencing analysis. Our results showed a very high homology of apolipoprotein E sequences in the examined canines, including human APOE3 and human APOE4, ranging from 71.76-100 and 78.23-100% identity and similarity, respectively. All investigated canine breeds could be identified as APOE4 carriers due to the presence of arginine at the positions 112 and 158, which correspond to APOE4 of human. This indicates that APOE polymorphism was not present in the genome of all examined canine breeds. It is possible that the finding of canine apolipoprotein E4 may be important in predicting an increased risk of pathophysiological development of neurodegenerative diseases and coronary heart disease. Our reconstructed phylogenetic tree showed two well-defined clusters based on the amino acid sequence of apolipoprotein E, including canine and human group. Further studies should explore if these different clusters are associated with diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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