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Enregistrement W4292242254 · doi:10.1016/j.ccell.2022.07.011

De novo pyrimidine synthesis is a targetable vulnerability in IDH mutant glioma

2022· article· en· W4292242254 sur OpenAlexaff
Diana D. Shi, Milan R. Savani, Michael M. Levitt, Adam C. Wang, Jennifer E. Endress, Cylaina Bird, Joseph Buehler, Sylwia A. Stopka, Michael S. Regan, Yu‐Fen Lin, Vinesh T. Puliyappadamba, Wenhua Gao, Januka Khanal, Laura Evans, J Lee, Lei Guo, Yi Xiao, Min Xu, Bofu Huang, Rebecca B. Jennings, Dennis M. Bonal, Misty S. Martin-Sandoval, Tammie Dang, Lauren C. Gattie, Amy Cameron, Sung-Woo Lee, John M. Asara, Harley I. Kornblum, Tak W. Mak, Ryan Looper, Quang‐Dé Nguyen, Sabina Signoretti, Stefan Gradl, Andreas Sutter, Michael Jeffers, Andreas Janzer, Mark A. Lehrman, Lauren G. Zacharias, Thomas P. Mathews, Julie-Aurore Losman, Timothy E. Richardson, Daniel P. Cahill, Ralph J. DeBerardinis, Keith L. Ligon, Lin Xu, Peter Ly, Nathalie Y.R. Agar, Kalil G. Abdullah, Isaac S. Harris, William G. Kaelin, Samuel K. McBrayer

Notice bibliographique

RevueCancer Cell · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Molecular Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Cancer InstituteLudwig Center at HarvardNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesHarvard Medical SchoolSontag FoundationEMD SeronoUniversity of Texas Medical BranchHoward Hughes Medical InstituteCancer Prevention and Research Institute of TexasV Foundation for Cancer ResearchDana-Farber Cancer InstitutePharmaceuticals BayerEli Lilly and Company
Mots-clésIsocitrate dehydrogenaseGliomaDihydroorotate dehydrogenaseMutantBiologyPyrimidine metabolismIDH1Cancer researchEnzymeBiochemistryPurineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations affecting isocitrate dehydrogenase (IDH) enzymes are prevalent in glioma, leukemia, and other cancers. Although mutant IDH inhibitors are effective against leukemia, they seem to be less active in aggressive glioma, underscoring the need for alternative treatment strategies. Through a chemical synthetic lethality screen, we discovered that IDH1-mutant glioma cells are hypersensitive to drugs targeting enzymes in the de novo pyrimidine nucleotide synthesis pathway, including dihydroorotate dehydrogenase (DHODH). We developed a genetically engineered mouse model of mutant IDH1-driven astrocytoma and used it and multiple patient-derived models to show that the brain-penetrant DHODH inhibitor BAY 2402234 displays monotherapy efficacy against IDH-mutant gliomas. Mechanistically, this reflects an obligate dependence of glioma cells on the de novo pyrimidine synthesis pathway and mutant IDH's ability to sensitize to DNA damage upon nucleotide pool imbalance. Our work outlines a tumor-selective, biomarker-guided therapeutic strategy that is poised for clinical translation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations129
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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