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Enregistrement W4292371797 · doi:10.1038/s41467-022-32376-z

SARS CoV-2 mRNA vaccination exposes latent HIV to Nef-specific CD8+ T-cells

2022· article· en· W4292371797 sur OpenAlexafffund
Eva M. Stevenson, Sandra Terry, Dennis C. Copertino, Louise Leyre, Ali Danesh, Jared Weiler, Adam R. Ward, Pragya Khadka, Evan McNeil, Kevin Bernard, Itzayana G. Miller, Grant Ellsworth, Carrie D. Johnston, Eli J. Finkelsztein, Paul Zumbo, Doron Betel, Friederike Dündar, Maggie C. Duncan, Hope R. Lapointe, Sarah Speckmaier, Nadia Moran-Garcia, Michelle Premazzi Papa, Samuel Nicholes, Carissa J. Stover, Rebecca M. Lynch, Marina Caskey, Christian Gaebler, Tae‐Wook Chun, Alberto Bosque, Timothy Wilkin, Guinevere Q. Lee, Zabrina L. Brumme, R. Brad Jones

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensAIDS VancouverSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute on Drug AbuseCanadian Institutes of Health ResearchU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BCNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteWeill Cornell Medical College
Mots-clésGranzyme BCytotoxic T cellCD8GranzymeImmunologyHIV vaccineVirologyBiologyImmune systemGranzyme AVaccinationT cellEffectorPerforinGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Efforts to cure HIV have focused on reactivating latent proviruses to enable elimination by CD8 + cytotoxic T-cells. Clinical studies of latency reversing agents (LRA) in antiretroviral therapy (ART)-treated individuals have shown increases in HIV transcription, but without reductions in virologic measures, or evidence that HIV-specific CD8 + T-cells were productively engaged. Here, we show that the SARS-CoV-2 mRNA vaccine BNT162b2 activates the RIG-I/TLR – TNF – NFκb axis, resulting in transcription of HIV proviruses with minimal perturbations of T-cell activation and host transcription. T-cells specific for the early gene-product HIV-Nef uniquely increased in frequency and acquired effector function (granzyme-B) in ART-treated individuals following SARS-CoV-2 mRNA vaccination. These parameters of CD8 + T-cell induction correlated with significant decreases in cell-associated HIV mRNA, suggesting killing or suppression of cells transcribing HIV. Thus, we report the observation of an intervention-induced reduction in a measure of HIV persistence, accompanied by precise immune correlates, in ART-suppressed individuals. However, we did not observe significant depletions of intact proviruses, underscoring challenges to achieving (or measuring) HIV reservoir reductions. Overall, our results support prioritizing the measurement of granzyme-B-producing Nef-specific responses in latency reversal studies and add impetus to developing HIV-targeted mRNA therapeutic vaccines that leverage built-in LRA activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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