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Enregistrement W4292527439 · doi:10.47068/ctns.2022.v11i21.037

NEW THERMOPHILIC THERMOBIFIDA STRAIN KB-T3 FROM ALGERIAN SAHARAN SOIL: ISOLATION AND POLYPHASIC TAXONOMY

2022· article· en· W4292527439 sur OpenAlexaff
Nacera Benoussaid, Dalila Boubetra, Affaf Laassami, Khaoula Bouznada, Michael J. Holtz, Noureddine Bouras, Atika Meklat

Notice bibliographique

RevueCURRENT TRENDS IN NATURAL SCIENCES · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensAgriculture Food and Rural Development
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNational Brain Research Centre
Mots-clés16S ribosomal RNABiologyMyceliumXyloseStrain (injury)ThermophileMicrobiologyBotanyBacteriaBiochemistryFermentationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During a screening for the diversity of actinobacterial strains from Saharan soil samples collected from Béchar region (Algeria), one strain designated KB-T3 was isolated by dilution technique on chitin-vitamins agar medium. The taxonomic position of this strain was determined by using a polyphasic approach. Morphological and chemical characteristics of the KB-T3 strain were consistent with those of the genus Thermobifida. The KB-T3 strain had a white aerial mycelium with dictomically branched sporophores carrying coccoid secluded spores. The substrate mycelium was pale yellow, sterile, and non-fragmented. The strain is characterized by the presence of meso-diaminopimelic acid in the cell wall, the galactose in whole-cell, and phosphatidylethanolamine in the cell membrane. The unique characteristic of this strain was its abundant growth with the absence of NaCl and in temperature‎ ranging from 40 to 65 °C, its capacity to decompose acetate, and its ability to use fructose, glucose and xylose as sole carbon source. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequence revealed that the strain KB-T3 should be classified in the genus Thermobifida and exhibited 99.79 % gene sequence similarity to Thermobifida fusca NBRC 14071T.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,837
Score d'incertitude au seuil0,483

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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