MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4292838468 · doi:10.1128/mra.00619-22

Near-Complete Genome Sequence of a SARS-CoV-2 Variant B.1.1.7 Virus Strain Isolated in Kazakhstan

2022· article· en· W4292838468 sur OpenAlexaff
Bekbolat Usserbayev, Kunsulu Zakaryа, Lespek Kutumbetov, Mukhit Orynbaуev, Kulyaisan Sultankulova, Yergali Abduraimov, Балжан Мырзахметова, Kuandyk Zhugunissov, Aslan Kerimbayev, Aibarys Melisbek, Meiіrzhan Shirinbekov, S. Khaidarov, Asankadyr Zhunushov, Yerbol Burashev

Notice bibliographique

RevueMicrobiology Resource Announcements · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesMinistry of Education and Science of the Republic of Kazakhstan
Mots-clésVirologyStrain (injury)Whole genome sequencingLineage (genetic)CoronavirusGenomeSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Sequence (biology)BiologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)VirusBetacoronavirusGeneticsGeneDiseaseMedicineInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This research describes the genome sequence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) obtained from a patient with symptoms of coronavirus disease 2019 (COVID-19) who was infected in the Republic of Kazakhstan. Strain SARS-CoV-2/human/KAZ/Britain/2021 consists of 29,815 nucleotides and belongs to lineage B.1.1.7, according to the Pangolin COVID-19 database.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicrobiology Resource AnnouncementsMême sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 ResearchTravaux en français237 207