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Enregistrement W4292860138 · doi:10.3390/microorganisms10091690

Seasonal Dynamics of Lake Winnipeg’s Microbial Communities Reveal Aerobic Anoxygenic Phototrophic Populations Coincide with Sunlight Availability

2022· article· en· W4292860138 sur OpenAlexafffundabout
Steven B. Kuzyk, Xiao Ma, Vladimir Yurkov

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLimnetic zoneAnoxygenic photosynthesisPhototrophLittoral zoneEcologyBiologyPhotic zoneHeterotrophMicrobial matEcosystemBiogeochemical cycleBotanyEnvironmental scienceOceanographyPhotosynthesisNutrientCyanobacteriaPhytoplanktonBacteriaGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this first comprehensive study of Lake Winnipeg’s microbial communities, limnetic and littoral euphotic zones were examined during each season from 2016 through 2020. Classical cultivation and modern high-throughput sequencing techniques provided quantification and identification of key phototrophic populations, including aerobic anoxygenic phototrophs (AAP). Annual dynamics found total heterotrophs reached 4.23 × 106 CFU/g in littoral sands, and 7.69 × 104 CFU/mL in summer littoral waters on oligotrophic media, higher counts than for copiotrophic compositions. Limnetic numbers inversely dipped to 4.34 × 103 CFU/mL midsummer. Cultured AAP did not follow heterotrophic trends, instead peaking during the spring in both littoral and limnetic waters as 19.1 and 4.7% of total copiotrophs, or 3.9 and 4.9% of oligotrophs, decreasing till autumn each year. Complementary observations came from environmental 16S V4 rRNA gene analysis, as AAP made up 1.49 and 1.02% of the littoral and limnetic sequenced communities in the spring, declining with seasonal progression. Spatial and temporal fluctuations of microbes compared to environmental factors exposed photosynthetic populations to independently and regularly fluctuate in the ecosystem. Oxygenic phototrophic numbers expectantly matched the midsummer peak of Chl a and b, oxygenic photosynthesis related carbon fixation, and water temperature. Independently, AAP particularly colonized spring littoral areas more than limnetic, and directly corresponded to habitat conditions that specifically promoted growth: the requirement of light and organic material.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,699
Score d'incertitude au seuil0,598

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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