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Enregistrement W4292862014 · doi:10.1016/j.ebiom.2022.104206

The relationship between the epigenetic aging biomarker “grimage” and lung function in both the airway and blood of people living with HIV: An observational cohort study

2022· article· en· W4292862014 sur OpenAlexafffundabout
Ana I. Hernández Cordero, Chen Xi Yang, Julia Yang, Xuan Li, Steve Horvath, Tawimas Shaipanich, Julia L. MacIsaac, David Lin, Lisa M. McEwen, Michael S. Kobor, Silvia Guillemi, Marianne Harris, Wan L. Lam, Stephen Lam, Ma’en Obeidat, Richard Novák, Fleur Hudson, Hartwig Klinker, Nila J. Dharan, Joan Montaner, S. F. Paul Man, Ken M. Kunisaki, Don D. Sin, Janice M. Leung, Jason V. Baker, Daniel Duprez, Andrew Carr, Jennifer Hoy, M. Dolan, A. Telenti, C. Grady, Gail Matthews, Jürgen K. Rockstroh, Waldo Belloso, Jonathan Kagan, Edwina Wright, Bruce J. Brew, R.W. Price, K. Robertson, Lucette A. Cysique, JE Connett, D.E. Niewoehner, Alan R. Lifson, R.T. Davey, J.M. Gatell, C Pedersen, Ronald J. Prineas, Jason Worley

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensProvidence Health CareAIDS VancouverSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesBritish Columbia Lung AssociationNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BCCanadian Institutes of Health ResearchMitacsSt. Paul's Foundation
Mots-clésEpigeneticsBiomarkerLung functionMedicineObservational studyCohort studyHuman immunodeficiency virus (HIV)CohortAirwayLungGerontologyBioinformaticsImmunologyInternal medicineBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Age-related comorbidities such as chronic obstructive pulmonary disease (COPD) are common in people living with human immunodeficiency virus (PLWH). We investigated the relationship between COPD and the epigenetic age of the airway epithelium and peripheral blood of PLWH. METHODS: decline over 6 years in blood. FINDINGS: /FVC<0.70 over the course of 6 years had higher GrimAge residuals at baseline (Beta=2.33, 95%CI=0.23-4.44, P=0.031). INTERPRETATION: GrimAge may reflect lung and systemic epigenetic changes that occur with advanced airflow obstruction and may help to identify PLWH with a higher risk of developing COPD. FUNDING: Canadian Institutes of Health Research and the British Columbia Lung Association. The START substudy was funded by NIH grants: UM1-AI068641, UM1-AI120197, and RO1HL096453.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,377

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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