MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4293069360 · doi:10.1101/2022.08.18.22278949

Maximizing the impact of limited vaccine supply under different epidemic conditions: a two-city monkeypox modelling analysis

2022· preprint· en· W4293069360 sur OpenAlexafffundabout
Jesse Knight, Darrell H. S. Tan, Sharmistha Mishra

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto
Mots-clésPrioritizationContext (archaeology)Transmission (telecommunications)OutbreakTime horizonOptimal allocationGeographyComputer scienceBusinessMathematicsBiologyVirologyMathematical optimizationTelecommunicationsFinance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract background In the current global monkeypox outbreak, many jurisdictions have been faced with limited vaccine supply, motivating interest in efficient allocation. We sought to explore optimal vaccine allocation between two linked transmission networks over a short-term time horizon, across a range of epidemic conditions. methods We constructed a deterministic compartmental sveir model of monkeypox transmission. We parameterized the model to reflect two representative, weakly connected gbmsm sexual networks (cities) in Ontario. We simulated roll-out of 5000 vaccine doses over 15 days, starting 60 days after epidemic seeding with 10 imported cases. Within this model, we varied: the relative city (network) sizes, epidemic potentials ( R 0 ), between-city mixing, and distribution of imported/seed cases between cities. In each context (combination of varied factors), we then identified the “optimal” allocation of doses between cities — resulting in the fewest cumulative infections by day 120. results Under our modelling assumptions, we found that a fixed supply of vaccines could generally avert more infections over short-term time horizons when prioritized to: a larger transmission network, a network with more initial infections, and/or a network with greater R 0 . Greater between-city mixing decreased the influence of initial seed cases, and increased the influence of city R 0 on optimal allocation. Under mixed conditions (e.g. fewer seed cases but greater R 0 ), optimal allocation saw doses shared between cities, suggesting that proximity-based and risk-based vaccine prioritization can work in combination to minimize transmission. interpretation Prioritization of limited vaccine supply based on network-level risk factors can help minimize transmission during an emerging epidemic. Such prioritization should be grounded in an understanding of context-specific drivers of risk, and should acknowledge the potential connectedness of multiple transmission networks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,519
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxivMême sujetPoxvirus research and outbreaksTravaux en français237 207