Chromosome 9p21.3 Coordinates Cell Intrinsic and Extrinsic Tumor Suppression
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY Somatic chromosomal deletions are prevalent in cancer, yet their functional contributions remain ill-defined. Among the most prominent of these events are deletions of chromosome 9p21.3, which disable a cell intrinsic barrier to tumorigenesis by eliminating the CDKN2A/B tumor suppressor genes. However, half of 9p21.3 deletions encompass a cluster of 16 type I interferons (IFNs) whose co-deletions have not been functionally characterized. To dissect how 9p21.3 and other genomic deletions impact cancer, we developed MACHETE (Molecular Alteration of Chromosomes with Engineered Tandem Elements), a genome engineering strategy that enables flexible modeling of megabase-sized deletions. Generation of 9p21.3-syntenic deletions in a mouse model of pancreatic cancer revealed that concomitant loss of Cdkn2a/b and the IFN cluster led to immune evasion and metastasis compared to Cdkn2a/b -only deletions. Mechanistically, IFN co-deletion disrupted type I IFN signaling, altered antigen-presenting cells, and facilitated escape from CD8+ T cell surveillance in a cell extrinsic manner requiring loss of interferon epsilon ( Ifne ). Our results establish co-deletions of the IFN cluster as a pervasive route to tumor immune evasion and metastasis, revealing how deletions can disable physically linked cell intrinsic and extrinsic tumor suppression. Our study establishes a framework to dissect the functions of genomic deletions in cancer and beyond.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».