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Enregistrement W4294233687 · doi:10.1038/s41598-022-19103-w

Effect of MA01 rhamnolipid on cell viability and expression of quorum-sensing (QS) genes involved in biofilm formation by methicillin-resistant Staphylococcus aureus

2022· article· en· W4294233687 sur OpenAlexaff
Fatemeh Saadati, Shahab Shahryari, Naeema Mohseni Sani, Davoud Farajzadeh, Hossein Shahbani Zahiri, Hojatollah Vali, Kambiz Akbari Noghabi

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute for Genetic Engineering and Biotechnology
Mots-clésRhamnolipidBiofilmQuorum sensingMicrobiologyViability assayPseudomonas aeruginosaStaphylococcus aureusBacteriaMembrane permeabilityBiologyFlow cytometryBacterial cell structureChemistryCellBiochemistryMembraneMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A group of biosurfactants, called rhamnolipids, have been shown to have antibacterial and antibiofilm activity against multidrug-resistant bacteria. Here, we examined the effect of rhamnolipid biosurfactants extracted from Pseudomonas aeruginosa MA01 on cell growth/viability, biofilm formation, and membrane permeability of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) ATCC6538 bacterial cells. The results obtained from flow cytometry analysis showed that by increasing the concentration of rhamnolipid from 30 to 120 mg/mL, the cell viability decreased by about 70%, and the cell membrane permeability increased by approximately 20%. In fact, increasing rhamnolipid concentration was directly related to cell membrane permeability and inversely related to cell survival. Microtiter plate biofilm assay and laser scanning confocal microscopy analysis revealed that rhamnolipid, at a concentration of 60 mg/mL, exerts a reducing effect on the biofilm formation of Staphylococcus aureus. Real-time PCR analysis for monitoring the relative changes in the expression of agrA, agrC, icaA, and icaD genes involved in biofilm formation and related to the quorum-sensing pathway after treatment with rhamnolipid indicated a reduced expression level of these genes, as well as sortase A gene. The results of the present study deepen our knowledge regarding the use of microbial natural products as promising candidates for therapeutic applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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