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Enregistrement W4294613008 · doi:10.1111/irv.13039

Symptom‐based case definitions for COVID‐19: Time and geographical variations for detection at hospital admission among 260,000 patients

2022· article· en· W4294613008 sur OpenAlexafffund
Joaquín Baruch, Amanda Rojek, Christiana Kartsonaki, Bharath Kumar Tirupakuzhi Vijayaraghavan, Bronner P. Gonçalves, Mark G. Pritchard, Laura Merson, Jake Dunning, Matthew Hall, Louise Sigfrid, Barbara Wanjiru Citarella, Srinivas Murthy, Trokon Yeabah, Piero Olliaro

Notice bibliographique

RevueInfluenza and Other Respiratory Viruses · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSepsis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNIHR Cambridge Biomedical Research CentreNIHR Imperial Biomedical Research CentreNIHR Clinical Research Network Thames Valley and South MidlandsHelse Sør-Øst RHFInstituto de Salud Carlos IIICanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthKementerian Kesihatan MalaysiaAll-India Institute of Medical SciencesMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaImperial College LondonConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoPublic Health EnglandWellcome TrustCancer Research UKUniversity College DublinForeign, Commonwealth and Development OfficeNational Institute for Health Research Health Protection Research UnitNorges ForskningsrådUniversity of OxfordPrince Charles Hospital FoundationMinistère des Affaires Sociales et de la SantéInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleSunnybrook Research InstituteLiverpool School of Tropical MedicineDepartment of Health and Aged Care, Australian GovernmentNational Institute for Health and Care ResearchMinistero della SaluteFirland FoundationEuropean CommissionBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésMedicineCase fatality rateCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Disease controlCohortDiseaseDemographyPediatricsFamily medicineEmergency medicineEpidemiologyEnvironmental healthInternal medicineInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Case definitions are used to guide clinical practice, surveillance and research protocols. However, how they identify COVID-19-hospitalised patients is not fully understood. We analysed the proportion of hospitalised patients with laboratory-confirmed COVID-19, in the ISARIC prospective cohort study database, meeting widely used case definitions. Methods: Patients were assessed using the Centers for Disease Control (CDC), European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), World Health Organization (WHO) and UK Health Security Agency (UKHSA) case definitions by age, region and time. Case fatality ratios (CFRs) and symptoms of those who did and who did not meet the case definitions were evaluated. Patients with incomplete data and non-laboratory-confirmed test result were excluded. Results: A total of 263,218 of the patients (42%) in the ISARIC database were included. Most patients (90.4%) were from Europe and Central Asia. The proportions of patients meeting the case definitions were 56.8% (WHO), 74.4% (UKHSA), 81.6% (ECDC) and 82.3% (CDC). For each case definition, patients at the extremes of age distribution met the criteria less frequently than those aged 30 to 70 years; geographical and time variations were also observed. Estimated CFRs were similar for the patients who met the case definitions. However, when more patients did not meet the case definition, the CFR increased. Conclusions: The performance of case definitions might be different in different regions and may change over time. Similarly concerning is the fact that older patients often did not meet case definitions, risking delayed medical care. While epidemiologists must balance their analytics with field applicability, ongoing revision of case definitions is necessary to improve patient care through early diagnosis and limit potential nosocomial spread.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,808
Score d'incertitude au seuil0,725

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,157
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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