MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4294659898 · doi:10.1093/brain/awac315

Brain functional connectivity mirrors genetic pleiotropy in psychiatric conditions

2022· article· en· W4294659898 sur OpenAlexafffund
Clara Moreau, Kuldeep Kumar, Annabelle Harvey, Guillaume Huguet, Sebastian Urchs, Laura M. Schultz, Hanad Sharmarke, Khadijé Jizi, Charles-Olivier Martin, Nadine Younis, Petra Tamer, Jean-Louis Martineau, Pierre Orban, Ana Isabel Silva, Jérémy Hall, Marianne B. M. van den Bree, Michael J. Owen, David E.J. Linden, Sarah Lippé, Carrie E. Bearden, Laura Almasy, David C. Glahn, Paul M. Thompson, Thomas Bourgeron, Pierre Bellec, Sébastien Jacquemont

Notice bibliographique

RevueBrain · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensInstitut Universitaire en Santé Mentale de QuébecMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de MontréalInstitut Universitaire de Gériatrie de Montréal
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentU.S. National Library of MedicineNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingMedical Research CouncilSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Institutes of HealthCanada First Research Excellence FundNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchCentre Hospitalier Universitaire VaudoisSimons FoundationHealth and Care Research WalesCourtois FoundationWellcome TrustNational Institute on Drug AbuseInstitut de Valorisation des DonnéesFondation Brain CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCompute Canada
Mots-clésFunctional connectivityPleiotropyNeurosciencePsychologyPsychiatryGeneticsBiologyPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pleiotropy occurs when a genetic variant influences more than one trait. This is a key property of the genomic architecture of psychiatric disorders and has been observed for rare and common genomic variants. It is reasonable to hypothesize that the microscale genetic overlap (pleiotropy) across psychiatric conditions and cognitive traits may lead to similar overlaps at the macroscale brain level such as large-scale brain functional networks. We took advantage of brain connectivity, measured by resting-state functional MRI to measure the effects of pleiotropy on large-scale brain networks, a putative step from genes to behaviour. We processed nine resting-state functional MRI datasets including 32 726 individuals and computed connectome-wide profiles of seven neuropsychiatric copy-number-variants, five polygenic scores, neuroticism and fluid intelligence as well as four idiopathic psychiatric conditions. Nine out of 19 pairs of conditions and traits showed significant functional connectivity correlations (rFunctional connectivity), which could be explained by previously published levels of genomic (rGenetic) and transcriptomic (rTranscriptomic) correlations with moderate to high concordance: rGenetic-rFunctional connectivity = 0.71 [0.40-0.87] and rTranscriptomic-rFunctional connectivity = 0.83 [0.52; 0.94]. Extending this analysis to functional connectivity profiles associated with rare and common genetic risk showed that 30 out of 136 pairs of connectivity profiles were correlated above chance. These similarities between genetic risks and psychiatric disorders at the connectivity level were mainly driven by the overconnectivity of the thalamus and the somatomotor networks. Our findings suggest a substantial genetic component for shared connectivity profiles across conditions and traits, opening avenues to delineate general mechanisms-amenable to intervention-across psychiatric conditions and genetic risks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,744
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBrainMême sujetCongenital heart defects researchTravaux en français237 207