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Enregistrement W4294762973 · doi:10.1007/s00401-022-02454-z

Genome-wide meta-analysis for Alzheimer’s disease cerebrospinal fluid biomarkers

2022· review· en· W4294762973 sur OpenAlexaff
Iris E. Jansen, Sven J. van der Lee, Duber Gomez‐Fonseca, Itziar de Rojas, Carolina Dalmasso, Benjamin Grenier‐Boley, Anna Zettergren, Aniket Mishra, Muhammad Ali, Víctor Andrade, Céline Bellenguez, Luca Kleineidam, Fahri Küçükali, Yun Ju Sung, Niccoló Tesi, Eleonora M. Vromen, Douglas P. Wightman, Daniel Alcolea, Montserrat Alegret, Ignacio Álvarez, Philippe Amouyel, Lavinia Athanasiu, Shahram Bahrami, Henri Bailly, Olivia Belbin, Sverre Bergh, Lars Bertram, Geert Jan Biessels, Kaj Blennow, Rafael Blesa, Merçé Boada, Anne Boland, Katharina Büerger, Ángel Carracedo, Laura Cervera‐Carles, Geneviève Chêne, Jurgen A.H.R. Claassen, Stéphanie Debette, Jean‐François Deleuze, Peter Paul De Deyn, Janine Diehl‐Schmid, Srdjan Djurovic, Oriol Dols‐Icardo, Carole Dufouil, Emmanuelle Duron, Emrah Düzel, Tormod Fladby, Juan Fortea, Lutz Frölich, Pablo García‐González, María García‐Martínez, Ina Giegling, Oliver Goldhardt, Johan Gobom, Timo Grimmer, Annakaisa Haapasalo, Harald Hampel, Olivier Hanon, Lucrezia Hausner, Stefanie Heilmann‐Heimbach, Seppo Helisalmi, Michael T. Heneka, Isabel Hernández, Sanna‐Kaisa Herukka, Henne Holstege, Jonas Alexander Jarholm, Silke Kern, Anne‐Brita Knapskog, Anne M. Koivisto, Johannes Kornhuber, Teemu Kuulasmaa, Carmen Lage, Christoph Laske, Ville Leinonen, Piotr Lewczuk, Alberto Lleó, Adolfo López de Munain, Sara López‐García, Wolfgang Maier, Marta Marquié, Merel O. Mol, Laura Montrreal, Fermín Moreno, Sonia Moreno–Grau, Gaël Nicolas, Markus M. Nöthen, Adelina Orellana, Lene Pålhaugen, Janne M. Papma, Florence Pasquier, Robert Perneczky, Oliver Peters, Yolande A.L. Pijnenburg, Julius Popp, Daniëlle Posthuma, Ana Pozueta, Josef Priller, Raquel Puerta, Inés Quintela, Inez Ramakers, Eloy Rodríguez‐Rodríguez, Dan Rujescu, Ingvild Saltvedt, Pascual Sánchez‐Juan, Philip Scheltens, Norbert Scherbaum, Matthias Schmid, Anja Schneider, Geir Selbæk, Per Selnes, Alexey Shadrin, Ingmar Skoog, Hilkka Soininen, Lluís Tárraga, Stefan Teipel, Betty M. Tijms, Magda Tsolaki, Christine Van Broeckhoven, Jasper Van Dongen, John C. van Swieten, Rik Vandenberghe, Jean‐Sébastien Vidal, Pieter Jelle Visser, Jonathan Vogelgsang, Margda Wærn, Michael Wagner, Jens Wiltfang, Mandy Melissa Jane Wittens, Henrik Zetterberg, Miren Zulaica, Cornelia M. van Duijn, Maria Bjerke, Sebastiaan Engelborghs, Frank Jessen, Charlotte E. Teunissen, Pau Pástor, Mikko Hiltunen, Martin Ingelsson, Ole A. Andreassen, Jordi Clarimón, Kristel Sleegers, Agustı́n Ruiz, Alfredo Ramı́rez, Carlos Cruchaga, Jean‐Charles Lambert, Wiesje M. van der Flier

Notice bibliographique

RevueActa Neuropathologica · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensOntario Brain InstituteUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institutes of HealthFondation pour la Recherche sur AlzheimerJulius ClinicalCentro de Investigación Biomédica en Red sobre Enfermedades NeurodegenerativasServierInstituto de Salud Carlos IIISiemens HealthineersStichting DioraphteHersenstichtingUniversiteit AntwerpenOryzon GenomicsVetenskapsrådetEisaiFonds Wetenschappelijk OnderzoekNovo NordiskEuropean Regional Development FundBundesministerium für Bildung und ForschungAcademy of FinlandAmsterdam NeuroscienceZonMwNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekGrifolsAgence Nationale de la RechercheH. Lundbeck A/SSunovionDeutsches Zentrum für Neurodegenerative ErkrankungenDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchDanoneEuropean CommissionVlaamse regeringEsteve PharmaceuticalsAlzheimer NederlandPfizerBiogenHealth~HollandHope Center for Neurological DisordersEli Lilly and Company
Mots-clésCerebrospinal fluidBiobankPathogenesisEtiologyAlzheimer's diseaseLocus (genetics)Genome-wide association studyDementiaDiseaseBiologyApolipoprotein EMedicinePathologyBioinformaticsGeneticsGeneSingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amyloid-beta 42 (Aβ42) and phosphorylated tau (pTau) levels in cerebrospinal fluid (CSF) reflect core features of the pathogenesis of Alzheimer's disease (AD) more directly than clinical diagnosis. Initiated by the European Alzheimer & Dementia Biobank (EADB), the largest collaborative effort on genetics underlying CSF biomarkers was established, including 31 cohorts with a total of 13,116 individuals (discovery n = 8074; replication n = 5042 individuals). Besides the APOE locus, novel associations with two other well-established AD risk loci were observed; CR1 was shown a locus for Aβ42 and BIN1 for pTau. GMNC and C16orf95 were further identified as loci for pTau, of which the latter is novel. Clustering methods exploring the influence of all known AD risk loci on the CSF protein levels, revealed 4 biological categories suggesting multiple Aβ42 and pTau related biological pathways involved in the etiology of AD. In functional follow-up analyses, GMNC and C16orf95 both associated with lateral ventricular volume, implying an overlap in genetic etiology for tau levels and brain ventricular volume.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Méta-épidémiologie (sens large), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,481
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,012
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,263
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,134 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations138
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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