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Enregistrement W4294843893 · doi:10.1371/journal.pone.0272778

Sexual reproduction and auxospore development in the diatom Biddulphia biddulphiana

2022· article· en· W4294843893 sur OpenAlexafffund
Irena Kaczmarska, James M. Ehrman, Matt P. Ashworth

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensMount Allison University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMount Allison UniversityUniversity of Texas at AustinNational Science Foundation
Mots-clésBiologySexual reproductionReproductionEvolutionary biologyFrustuleMorphology (biology)Phylogenetic treeDiatomZoologyBotanyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phylogenetic relationships among mediophycean diatoms with elliptical valve outline and elevated apices have long been a subject of interest and debate, particularly with respect to their relationship to pennates. However, results remain inconclusive, whether based on vegetative valve morphology, reproduction, or molecular phylogenetic data. Searching for phylogenetically informative features, we re-examined sexual reproduction, auxospore structure and development in the diatom Biddulphia biddulphiana. Several unique or unusual features and processes characterized its sexual reproduction. A unique spermatogenesis occurs with premeiotic separation of an anucleate protoplast containing all chloroplasts and likely other organelles. Additionally, their auxospore walls are some of the most complex documented, retaining earlier deposited layers that obscure layers formed during later stages of development. The oldest layer consists of thick, mostly organic incunabulum, underlain by outer and inner epizonia and finally transverse (TP) and longitudinal (LP) perizonia. The complexity of the fine structure of these layers is unprecedented. The orientation of some TP bands is also unique in mediophytes, with some perpendicular to the auxospore apical axis, parallel to each other, and open with aligned ends, as typically seen in pennates. The TP also contains rings slanting toward the apices, as in some other mediophytes, e.g., eupodiscaceans. However, both eupodiscaceans and biddulphiaceans show perizonial band structure derived from anastomosing radial scales, thus termed "scaly bands". Pinnate TP bands, common among pennate auxospores, were not found. Thus B. biddulphiana auxospore wall structure contains a mixture of characters specific to this clone but also known from mediophytes and araphid pennates. However, these features do not provide unequivocal evidence that this or the other Biddulphia species examined to date are the closest extant relatives of basal araphid pennates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,451
Score d'incertitude au seuil0,555

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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