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Enregistrement W4295028397 · doi:10.21203/rs.3.rs-2026810/v1

Meta-analysis identifies common gut microbiota signatures in patients with multiple sclerosis

2022· preprint· en· W4295028397 sur OpenAlexaff
Qingqi Lin, Yair Dorsett, Ali Mirza, Helen Tremlett, Laura Piccio, Erin E. Longbrake, Siobhán Ní Choileáin, David A. Hafler, Laura M. Cox, Howard L. Weiner, Takashi Yamamura, Kun Chen, Yufeng Wu, Yanjiao Zhou

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesSun Yat-sen UniversityUniversity of Connecticut Health Center
Mots-clésPrevotellaMicrobiomeBiologyBacteroidesDysbiosisMultiple sclerosisGut floraClostridiaImmunologyBioinformaticsGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract BackgroundPrevious studies have identified a large number of distinct microbial taxa that are different between patients with multiple sclerosis (MS) and controls. However, interpretating findings on MS-associated microbiome is challenging as results do not completely concur and studies have included relatively few individuals. To date, it is unclear whether there is a common gut microbial signature in patients with MS across studies. To identity the most common compositional differences of the gut microbiome in MS versus healthy controls, we performed a meta-analysis. This was based on 16S rRNA gene sequences from seven published studies, comprising a total of 524 adult patients with MS and control subjects.ResultsWe found that although alpha and beta diversity did not differ between MS and controls, a lower relative abundance ofPrevotellaand a dysbiosis of numerous genera within theClostridiaclass were reproducibly associated with MS. Additionally, network analysis revealed that the recognized negativeBacteroides-Prevotellacorrelation in controls was disrupted in MS. immunosuppressive agents normalized MS-associated microbiomePrevotellato a similar level as healthy controls.ConclusionsOur meta-analysis revealed reproducible gut microbiome signatures in MS across geographically diverse studies. These findings form the basis for future novel therapeutic approaches and possibly enhanced MS recognition/diagnosis by targeting common microbiome signatures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,060

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,021
Bibliométrie0,0070,007
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0040,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,104
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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